More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2967 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2967  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 520 aa  1035    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4233  UvrD/REP helicase  23.4 
 
 		 769 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  29.75 
 
 		 682 aa  73.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  26.88 
 
 		 720 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.93 
 
 		 677 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.39 
 
 		 640 aa  72.4  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  23.93 
 
 		 677 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  24.2 
 
 		 720 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.47 
 
 		 513 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  28.96 
 
 		 779 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.404442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.88 
 
 		 658 aa  71.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  24.84 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  24.84 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  24.84 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  24.84 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  24.84 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  24.84 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  24.84 
 
 		 720 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  24.84 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  24.84 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  25.81 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  25.81 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  25.81 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  25.81 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  25.81 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  22.59 
 
 		 735 aa  69.7  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  26.62 
 
 		 720 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  26.8 
 
 		 509 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.85 
 
 		 658 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  25 
 
 		 722 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  28.67 
 
 		 671 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  30.35 
 
 		 797 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  27.02 
 
 		 720 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  28.67 
 
 		 671 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  25 
 
 		 722 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4475  UvrD/REP helicase  27.34 
 
 		 689 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  24.74 
 
 		 722 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  27.37 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  24.74 
 
 		 722 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  24.74 
 
 		 722 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  29.71 
 
 		 658 aa  67.8  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.5 
 
 		 671 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  24.74 
 
 		 722 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  24.42 
 
 		 722 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  23.34 
 
 		 679 aa  67  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.96 
 
 		 690 aa  67  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  25.8 
 
 		 721 aa  67  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4007  DNA-dependent helicase II  27.05 
 
 		 720 aa  66.6  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984144  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0545  DNA-dependent helicase II  27.05 
 
 		 720 aa  67  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  27.05 
 
 		 720 aa  67  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  25.09 
 
 		 721 aa  66.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  25.09 
 
 		 724 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2868  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.55 
 
 		 665 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1045  UvrD/REP helicase  28.18 
 
 		 587 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52657  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2731  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.55 
 
 		 665 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.33 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  24.42 
 
 		 722 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  28.62 
 
 		 797 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  24.42 
 
 		 722 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.38 
 
 		 756 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  25.82 
 
 		 722 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  25.8 
 
 		 727 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  23.58 
 
 		 625 aa  65.1  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 678 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  23.92 
 
 		 726 aa  65.1  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  25.54 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  25.65 
 
 		 663 aa  65.1  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 		 678 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  24.07 
 
 		 678 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  25.24 
 
 		 723 aa  63.9  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  25.32 
 
 		 677 aa  63.9  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6795  UvrD/REP helicase  37.61 
 
 		 571 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.357242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  25.09 
 
 		 721 aa  63.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  38.89 
 
 		 653 aa  63.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  36.59 
 
 		 1232 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  25.44 
 
 		 721 aa  63.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  27.46 
 
 		 787 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  27.46 
 
 		 787 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  27.46 
 
 		 787 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  27.46 
 
 		 787 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  34.31 
 
 		 726 aa  62.4  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.29 
 
 		 1051 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.67 
 
 		 671 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0055  UvrD/REP helicase  27.22 
 
 		 1112 aa  61.6  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  27.5 
 
 		 672 aa  62  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  27.12 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  25.12 
 
 		 719 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  27.12 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  27.12 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  24.91 
 
 		 723 aa  61.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  27.12 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0352  UvrD/REP helicase  36.47 
 
 		 709 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.877458  normal  0.0118212 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  27.81 
 
 		 726 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0721  UvrD/REP helicase  32.32 
 
 		 701 aa  60.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.64 
 
 		 663 aa  60.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  28.36 
 
 		 659 aa  60.5  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.91 
 
 		 725 aa  60.5  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 		 846 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.87 
 
 		 729 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3138  UvrD/REP helicase  26.45 
 
 		 689 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.527942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>