More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4233 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4233  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 769 aa  1576    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4270  hypothetical protein  92.05 
 
 		 263 aa  501  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal  0.278147 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2967  UvrD/REP helicase  22.67 
 
 		 520 aa  96.3  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  24.29 
 
 		 677 aa  70.9  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1050  UvrD/REP helicase  28.48 
 
 		 597 aa  67.4  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4111  UvrD/REP helicase  23.34 
 
 		 827 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  23.98 
 
 		 1044 aa  66.6  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  24.64 
 
 		 723 aa  65.5  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  24.38 
 
 		 754 aa  65.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  23.31 
 
 		 1060 aa  65.1  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  21.08 
 
 		 706 aa  65.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.48 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  35.14 
 
 		 783 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  24.01 
 
 		 804 aa  63.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  22.39 
 
 		 1089 aa  60.8  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 		 662 aa  60.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.16 
 
 		 662 aa  60.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  22.39 
 
 		 668 aa  60.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.2 
 
 		 659 aa  60.1  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.16 
 
 		 763 aa  59.3  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4207  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.31 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  23.35 
 
 		 706 aa  58.5  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  25 
 
 		 675 aa  58.2  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.14 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3000  UvrD/REP helicase  26.07 
 
 		 731 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.120838 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  24.24 
 
 		 668 aa  57  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.3 
 
 		 743 aa  57  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  24.04 
 
 		 680 aa  57.4  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.07 
 
 		 640 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.19 
 
 		 745 aa  56.6  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.48 
 
 		 759 aa  56.2  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0507  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.07 
 
 		 673 aa  56.2  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0177061  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4038  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.07 
 
 		 673 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  24.19 
 
 		 720 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3651  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.2 
 
 		 682 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3877  UvrD/REP helicase  39.53 
 
 		 696 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5211  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.34 
 
 		 673 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 659 aa  55.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0060  ATP-dependent DNA helicase Rep  39.53 
 
 		 696 aa  55.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  22.02 
 
 		 728 aa  55.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  28.89 
 
 		 1134 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2302  UvrD/REP helicase  23.44 
 
 		 829 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556709  normal  0.916479 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  32.26 
 
 		 706 aa  55.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  22.62 
 
 		 745 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03656  DNA helicase and single-stranded DNA-dependent ATPase  34.34 
 
 		 673 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0354982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4199  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.34 
 
 		 673 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.33 
 
 		 663 aa  55.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4225  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.34 
 
 		 673 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4143  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.34 
 
 		 673 aa  55.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4288  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.34 
 
 		 673 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3994  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.34 
 
 		 673 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0175  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.07 
 
 		 673 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4142  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.34 
 
 		 673 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03605  hypothetical protein  34.34 
 
 		 673 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0230376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.3 
 
 		 690 aa  55.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12101  UvrD/REP helicase subunit B  25.08 
 
 		 1208 aa  55.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  22.67 
 
 		 817 aa  54.7  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3329  UvrD/REP helicase  39.53 
 
 		 695 aa  54.7  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544954  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 		 714 aa  54.7  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.04 
 
 		 765 aa  54.7  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  23.25 
 
 		 1041 aa  54.7  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.06 
 
 		 674 aa  54.7  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  23.49 
 
 		 646 aa  54.7  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  24.02 
 
 		 720 aa  54.7  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  22.76 
 
 		 1124 aa  54.3  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4281  UvrD/REP helicase  31.97 
 
 		 716 aa  54.3  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344477  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  24.84 
 
 		 773 aa  54.3  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1416  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.29 
 
 		 664 aa  54.3  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1226  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  32.29 
 
 		 664 aa  54.3  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  23.13 
 
 		 719 aa  54.3  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0146  UvrD/REP helicase  23.71 
 
 		 721 aa  53.9  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728084  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  21.39 
 
 		 678 aa  53.5  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0006  UvrD/REP helicase  32.61 
 
 		 945 aa  53.9  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.416534  hitchhiker  0.0000067994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.93 
 
 		 677 aa  53.5  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4007  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.21 
 
 		 673 aa  53.5  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00646067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3260  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.37 
 
 		 848 aa  53.9  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  25.99 
 
 		 630 aa  53.9  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3650  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.36 
 
 		 671 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  23.59 
 
 		 809 aa  53.9  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  22.71 
 
 		 779 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.404442 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.9 
 
 		 674 aa  53.9  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  35.96 
 
 		 1065 aa  52.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3002  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.36 
 
 		 700 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0122  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.37 
 
 		 733 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  23.38 
 
 		 666 aa  53.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3991  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.36 
 
 		 695 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  21.97 
 
 		 725 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3067  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.36 
 
 		 700 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.7 
 
 		 731 aa  52.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1535  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.36 
 
 		 700 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  34.31 
 
 		 749 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  23.14 
 
 		 1066 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  27.43 
 
 		 1162 aa  53.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  34 
 
 		 666 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3919  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.36 
 
 		 695 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0828794  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  30.77 
 
 		 1192 aa  52.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0253  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.47 
 
 		 669 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.33 
 
 		 672 aa  52.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  26.83 
 
 		 1128 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3303  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.36 
 
 		 700 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>