More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_12101 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_12101  UvrD/REP helicase subunit B  100 
 
 
1208 aa  2379    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12091  UvrD/REP helicase subunit B  95.2 
 
 
1208 aa  2186    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  91.31 
 
 
1208 aa  2079    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0953517  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11941  UvrD/REP helicase subunit B  69.86 
 
 
1212 aa  1649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14771  UvrD/REP helicase subunit B  32.13 
 
 
1261 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.248766 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10831  UvrD/REP helicase subunit B  31.03 
 
 
1265 aa  542  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.261186  normal  0.314032 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0645  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.82 
 
 
1261 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09621  UvrD/REP helicase subunit B  26.09 
 
 
1274 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1410  exodeoxyribonuclease V, beta subunit RecB  25.4 
 
 
1208 aa  509  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.828955  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1651  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.21 
 
 
1226 aa  509  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.99 
 
 
1200 aa  260  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.34 
 
 
1207 aa  258  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.42 
 
 
1203 aa  239  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0993  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.06 
 
 
1125 aa  239  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00861563  normal  0.126412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0906  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.84 
 
 
1115 aa  233  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.025647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0900  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.03 
 
 
1115 aa  231  9e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0917  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.03 
 
 
1115 aa  231  9e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45261  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2429  Exodeoxyribonuclease V  21.13 
 
 
1148 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.765298  hitchhiker  0.0020094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.54 
 
 
1199 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10641  exonuclease V beta subunit recB  20.73 
 
 
1094 aa  212  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000417929  normal  0.0791919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.7 
 
 
1109 aa  211  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915993  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1614  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.47 
 
 
1232 aa  209  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364449  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  22.17 
 
 
1224 aa  208  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0252  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.7 
 
 
1111 aa  205  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103947  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1901  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.57 
 
 
1224 aa  206  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3373  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.53 
 
 
1132 aa  205  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  21.75 
 
 
1208 aa  204  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.31 
 
 
1269 aa  204  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2025  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.67 
 
 
1224 aa  201  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.29 
 
 
1204 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1209  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.59 
 
 
1097 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1043  exonuclease V subunit beta  21.89 
 
 
1220 aa  199  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0991  exonuclease V subunit beta  21.89 
 
 
1220 aa  199  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3231  exonuclease V subunit beta  21.89 
 
 
1220 aa  199  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0929  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.13 
 
 
1216 aa  198  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2746  Exodeoxyribonuclease V  20.17 
 
 
1134 aa  196  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3389  exonuclease V subunit beta  21.18 
 
 
1203 aa  195  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.46 
 
 
1203 aa  194  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.73 
 
 
1226 aa  191  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  22.02 
 
 
1212 aa  191  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1748  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.75 
 
 
1241 aa  190  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.34 
 
 
1240 aa  186  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2111  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.52 
 
 
1251 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2642  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.3 
 
 
1229 aa  181  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.8 
 
 
1130 aa  180  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2967  exonuclease V subunit beta  22.47 
 
 
1170 aa  179  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.483472  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2295  Exodeoxyribonuclease V  22.16 
 
 
1110 aa  178  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.87 
 
 
1234 aa  177  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0918971  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02668  exonuclease V (RecBCD complex), beta subunit  22.61 
 
 
1180 aa  177  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02629  hypothetical protein  22.61 
 
 
1180 aa  177  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4085  exonuclease V subunit beta  22.92 
 
 
1180 aa  177  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.1 
 
 
1234 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4323  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.2 
 
 
1236 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182798  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1359  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.35 
 
 
1226 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1188  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.77 
 
 
1235 aa  176  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.513756  normal  0.625115 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0871  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.83 
 
 
1180 aa  174  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2966  exonuclease V subunit beta  22.83 
 
 
1180 aa  174  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0895  exonuclease V subunit beta  22.83 
 
 
1180 aa  174  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.861993  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.86 
 
 
1129 aa  174  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3140  exonuclease V subunit beta  22.61 
 
 
1180 aa  174  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1981  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.15 
 
 
1259 aa  174  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.335433  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1215  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.66 
 
 
1235 aa  174  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.513189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  22.56 
 
 
1183 aa  174  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3042  exonuclease V subunit beta  22.4 
 
 
1180 aa  173  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0735  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.92 
 
 
2007 aa  173  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2047  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.73 
 
 
1273 aa  173  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.680974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1936  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.87 
 
 
1251 aa  172  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0579  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.84 
 
 
1085 aa  170  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01028  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.1 
 
 
1336 aa  170  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2088  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.63 
 
 
1236 aa  170  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2838  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.64 
 
 
1230 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.506585  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2291  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.42 
 
 
1273 aa  168  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2768  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.69 
 
 
1286 aa  168  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1852  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.26 
 
 
1269 aa  168  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3263  exonuclease V subunit beta  22.84 
 
 
1181 aa  166  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2279  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.3 
 
 
1273 aa  166  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4565  hypothetical protein  23.3 
 
 
1273 aa  166  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2246  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.92 
 
 
1263 aa  166  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.919114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.64 
 
 
1200 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3007  exonuclease V subunit beta  21.44 
 
 
1189 aa  165  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2148  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.57 
 
 
1259 aa  164  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1774  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.13 
 
 
1274 aa  162  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3320  exonuclease V subunit beta  23.18 
 
 
1181 aa  161  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.602721 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  20.47 
 
 
1208 aa  161  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3220  exonuclease V subunit beta  23.12 
 
 
1181 aa  161  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03906  exodeoxyribonuclease V beta chain  20.42 
 
 
1357 aa  161  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.42 
 
 
1209 aa  161  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4568  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.34 
 
 
1263 aa  160  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3157  exonuclease V subunit beta  22.81 
 
 
1181 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3140  exonuclease V subunit beta  22.88 
 
 
1181 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3206  exonuclease V subunit beta  23.07 
 
 
1181 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.146819  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4671  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.11 
 
 
1224 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2171  Exodeoxyribonuclease V  26.32 
 
 
1152 aa  156  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0681  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.68 
 
 
1230 aa  154  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.639627  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1624  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.02 
 
 
1240 aa  154  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.547512  normal  0.545211 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.92 
 
 
1240 aa  151  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.33 
 
 
1230 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2094  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.11 
 
 
1273 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.780628  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2932  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.59 
 
 
1198 aa  147  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2547  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.59 
 
 
1198 aa  147  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.789149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>