262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3627 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  100 
 
 		 513 aa  1070    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  29.66 
 
 		 647 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  30.12 
 
 		 498 aa  176  7e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3510  superfamily I DNA/RNA helicase  29.37 
 
 		 600 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  30.54 
 
 		 509 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2163  putative DNA helicase  26.72 
 
 		 518 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  29.7 
 
 		 481 aa  156  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4241  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.23 
 
 		 555 aa  154  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  28.6 
 
 		 645 aa  154  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0879  hypothetical protein  29.01 
 
 		 485 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  27.96 
 
 		 1658 aa  152  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  28.46 
 
 		 536 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1452  hypothetical protein  29.01 
 
 		 487 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  27.59 
 
 		 503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  29.61 
 
 		 493 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3757  putative DNA helicase  28.46 
 
 		 501 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.62 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3759  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.04 
 
 		 500 aa  134  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  27.24 
 
 		 499 aa  131  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.3 
 
 		 519 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  29.02 
 
 		 493 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  25.67 
 
 		 499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  26.82 
 
 		 486 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  26.82 
 
 		 486 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  26.57 
 
 		 486 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  27.73 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4323  hypothetical protein  24.19 
 
 		 511 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2967  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 520 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 1127 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.69 
 
 		 1089 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  24.66 
 
 		 676 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1045  UvrD/REP helicase  22.92 
 
 		 587 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52657  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  24.1 
 
 		 678 aa  60.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 		 797 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 		 797 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  24.28 
 
 		 702 aa  60.1  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  33.91 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  25.79 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  26.04 
 
 		 768 aa  57.4  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  33.04 
 
 		 732 aa  57  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  32.32 
 
 		 668 aa  56.2  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 714 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.71 
 
 		 797 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  21.86 
 
 		 736 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  32.73 
 
 		 946 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  32.73 
 
 		 946 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25 
 
 		 719 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  25.26 
 
 		 676 aa  54.7  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0474  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.11 
 
 		 1469 aa  54.3  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 1244 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  32.08 
 
 		 735 aa  53.9  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  34.69 
 
 		 765 aa  53.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  31.12 
 
 		 757 aa  53.5  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.11 
 
 		 742 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  36.05 
 
 		 659 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  38.82 
 
 		 648 aa  52  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  25.21 
 
 		 712 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.02 
 
 		 671 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  25.09 
 
 		 723 aa  52  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  38.82 
 
 		 648 aa  52  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  24.37 
 
 		 779 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.404442 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  21.35 
 
 		 1027 aa  52  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  24.14 
 
 		 659 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  31.37 
 
 		 744 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  25.09 
 
 		 723 aa  52  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  24.4 
 
 		 735 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  37.21 
 
 		 671 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28810  putative DNA helicase  24.09 
 
 		 1707 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0849671  decreased coverage  0.0000000181114 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  37.21 
 
 		 671 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.17 
 
 		 765 aa  51.2  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  33.98 
 
 		 1180 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  24.54 
 
 		 724 aa  50.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  29.75 
 
 		 706 aa  50.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  24.24 
 
 		 646 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 		 719 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  27.42 
 
 		 858 aa  50.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  21.98 
 
 		 682 aa  50.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6795  UvrD/REP helicase  26.02 
 
 		 571 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.357242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  23.28 
 
 		 699 aa  50.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  32 
 
 		 736 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0740  UvrD/REP helicase  23.49 
 
 		 692 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.336615  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  24.64 
 
 		 717 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  40.96 
 
 		 681 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  23.14 
 
 		 697 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  22.7 
 
 		 715 aa  49.7  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  31.07 
 
 		 688 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.65 
 
 		 741 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  23.89 
 
 		 666 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 668 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.36 
 
 		 640 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  35.29 
 
 		 721 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.13 
 
 		 785 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  28.7 
 
 		 826 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0127  DNA helicase II  23.28 
 
 		 646 aa  48.9  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.889231  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  24.24 
 
 		 1174 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1708  UvrD/REP helicase  22.36 
 
 		 695 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  40.51 
 
 		 1177 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  33.96 
 
 		 1150 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  38.27 
 
 		 682 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  31.13 
 
 		 726 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>