More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1708 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1708  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 695 aa  1373    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  38.05 
 
 		 729 aa  348  3e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  34.54 
 
 		 774 aa  316  7e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  32.34 
 
 		 759 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  30.52 
 
 		 678 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.59 
 
 		 671 aa  230  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  32.55 
 
 		 671 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  32.34 
 
 		 671 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2179  UvrD/REP helicase  29.55 
 
 		 809 aa  209  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.577747  normal  0.847748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  32.19 
 
 		 682 aa  203  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4111  UvrD/REP helicase  30.64 
 
 		 827 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 706 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  27.03 
 
 		 696 aa  197  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.75 
 
 		 729 aa  196  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  30.49 
 
 		 688 aa  194  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  29.38 
 
 		 706 aa  194  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.26 
 
 		 718 aa  192  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1518  ATP-dependent helicase PcrA  29.39 
 
 		 766 aa  191  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.291194 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.09 
 
 		 662 aa  188  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.33 
 
 		 739 aa  187  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3746  UvrD/REP helicase  29.52 
 
 		 730 aa  187  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.84 
 
 		 829 aa  187  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  23.63 
 
 		 735 aa  187  8e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.04 
 
 		 773 aa  186  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  29.06 
 
 		 768 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  27.51 
 
 		 721 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.39 
 
 		 802 aa  184  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  30.14 
 
 		 685 aa  183  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  28.44 
 
 		 845 aa  183  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.68 
 
 		 781 aa  183  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.14 
 
 		 763 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  25.15 
 
 		 689 aa  180  5.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  28.71 
 
 		 653 aa  180  7e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.99 
 
 		 831 aa  179  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  27.22 
 
 		 630 aa  180  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  27.79 
 
 		 726 aa  179  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.88 
 
 		 669 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.88 
 
 		 669 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  25.22 
 
 		 789 aa  178  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.73 
 
 		 669 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  30.33 
 
 		 707 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.11 
 
 		 669 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.13 
 
 		 755 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.67 
 
 		 892 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  28.81 
 
 		 741 aa  177  8e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0075  ATP-dependent DNA helicase RepA  26.42 
 
 		 669 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0253  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.62 
 
 		 669 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.58 
 
 		 669 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  27.29 
 
 		 722 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  27.02 
 
 		 722 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.79 
 
 		 706 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.54 
 
 		 669 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  27.29 
 
 		 722 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  26.84 
 
 		 720 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  26.84 
 
 		 720 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  26.84 
 
 		 720 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  26.84 
 
 		 720 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  29.84 
 
 		 668 aa  175  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.51 
 
 		 857 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  26.84 
 
 		 720 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  27.14 
 
 		 722 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  26.33 
 
 		 721 aa  174  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  26.69 
 
 		 720 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  24.19 
 
 		 773 aa  174  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  27.59 
 
 		 826 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  26.69 
 
 		 720 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  26.69 
 
 		 720 aa  174  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  26.69 
 
 		 720 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  26.69 
 
 		 720 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  26.69 
 
 		 720 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  26.69 
 
 		 720 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  26.69 
 
 		 720 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  26.69 
 
 		 720 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  27.37 
 
 		 786 aa  173  7.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  32.6 
 
 		 715 aa  173  9e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  27.17 
 
 		 722 aa  173  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  28.92 
 
 		 762 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 825 aa  173  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  25.04 
 
 		 687 aa  173  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  27.02 
 
 		 722 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  26.66 
 
 		 726 aa  173  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.57 
 
 		 786 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  26.85 
 
 		 722 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  29.62 
 
 		 668 aa  172  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5519  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.1 
 
 		 669 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  29.52 
 
 		 771 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  26.27 
 
 		 769 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  26.21 
 
 		 722 aa  172  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  27.02 
 
 		 722 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  27.02 
 
 		 722 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  27.09 
 
 		 721 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 		 724 aa  171  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2745  UvrD/REP helicase  30.44 
 
 		 687 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223218  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.46 
 
 		 730 aa  171  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.46 
 
 		 730 aa  171  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  26.07 
 
 		 724 aa  171  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  26.73 
 
 		 858 aa  170  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.47 
 
 		 858 aa  170  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.68 
 
 		 768 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.41 
 
 		 838 aa  170  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>