192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3757 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3757  putative DNA helicase  100 
 
 		 501 aa  1043    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3510  superfamily I DNA/RNA helicase  42.66 
 
 		 600 aa  355  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2163  putative DNA helicase  41.9 
 
 		 518 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  35.13 
 
 		 498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  32.02 
 
 		 645 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  31.43 
 
 		 481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  32.26 
 
 		 647 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  30.92 
 
 		 503 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4241  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.14 
 
 		 555 aa  179  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  30.91 
 
 		 509 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1452  hypothetical protein  30.39 
 
 		 487 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.62 
 
 		 519 aa  171  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0879  hypothetical protein  30.24 
 
 		 485 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  30.06 
 
 		 486 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  29.58 
 
 		 1658 aa  150  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3759  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.11 
 
 		 500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  30.64 
 
 		 536 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  28.69 
 
 		 493 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  28.32 
 
 		 486 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  28.32 
 
 		 486 aa  143  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  29.03 
 
 		 499 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  28.29 
 
 		 493 aa  136  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  28.82 
 
 		 499 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  26.81 
 
 		 500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.7 
 
 		 505 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.26 
 
 		 513 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4323  hypothetical protein  25.21 
 
 		 511 aa  110  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 678 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  27.15 
 
 		 722 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  27.15 
 
 		 722 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  26.8 
 
 		 722 aa  63.9  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  27.65 
 
 		 722 aa  63.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  26.8 
 
 		 722 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  26.8 
 
 		 722 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  26.8 
 
 		 722 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  26.8 
 
 		 722 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  25.7 
 
 		 729 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1708  UvrD/REP helicase  23.57 
 
 		 695 aa  62.4  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  26.46 
 
 		 722 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  23.56 
 
 		 643 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  26.58 
 
 		 722 aa  60.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  25.91 
 
 		 720 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  25.91 
 
 		 720 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  25.91 
 
 		 720 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  25.91 
 
 		 720 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  25.91 
 
 		 720 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  25.32 
 
 		 759 aa  56.6  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  25.09 
 
 		 721 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  26.03 
 
 		 721 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  37.76 
 
 		 721 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  25.43 
 
 		 720 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  25.43 
 
 		 720 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  25.43 
 
 		 720 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  26.74 
 
 		 1060 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  25.43 
 
 		 720 aa  55.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  25.43 
 
 		 720 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  25.43 
 
 		 720 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  25.43 
 
 		 720 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  28.12 
 
 		 677 aa  54.7  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  25.43 
 
 		 720 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  25.43 
 
 		 720 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0545  DNA-dependent helicase II  25.86 
 
 		 720 aa  54.3  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  25.25 
 
 		 727 aa  54.3  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4007  DNA-dependent helicase II  25.86 
 
 		 720 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  25.86 
 
 		 720 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0661  UvrD/REP helicase  25.57 
 
 		 708 aa  53.9  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612479  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4204  UvrD/REP helicase  28.04 
 
 		 599 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  25.09 
 
 		 720 aa  53.5  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  25.33 
 
 		 726 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0782  ATP-dependent DNA helicase  28.21 
 
 		 675 aa  52.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1235  putative ATP-dependent DNA helicase  29.06 
 
 		 676 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  34.34 
 
 		 726 aa  51.6  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0868  putative ATP-dependent DNA helicase  28.68 
 
 		 676 aa  51.2  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  26.01 
 
 		 725 aa  51.6  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.17 
 
 		 1089 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0798  putative ATP-dependent DNA helicase  28.68 
 
 		 676 aa  51.2  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  24.58 
 
 		 727 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5096  UvrD/REP helicase  23.27 
 
 		 613 aa  50.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83963 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1726  UvrD/REP helicase  25.08 
 
 		 593 aa  50.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1255  putative site-specific DNA methyltransferase  26.95 
 
 		 677 aa  50.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.3 
 
 		 1051 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  25.55 
 
 		 723 aa  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  26.07 
 
 		 1074 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0675  UvrD/REP helicase  23.43 
 
 		 599 aa  50.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  35.24 
 
 		 727 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  27.47 
 
 		 1184 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.57 
 
 		 833 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  34.48 
 
 		 659 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5077  UvrD/REP helicase  24.6 
 
 		 600 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935976  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  26.52 
 
 		 676 aa  48.9  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  28.57 
 
 		 720 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  25.08 
 
 		 724 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  24.58 
 
 		 727 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  23.55 
 
 		 678 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  25.26 
 
 		 728 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0127  DNA helicase II  24.91 
 
 		 646 aa  48.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.889231  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  22.04 
 
 		 726 aa  48.5  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  28.37 
 
 		 720 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  22.07 
 
 		 706 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  40.62 
 
 		 720 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>