More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0675 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0675  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 599 aa  1243    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1873  UvrD/REP helicase  38.29 
 
 		 591 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.100548  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  27.36 
 
 		 625 aa  150  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  26.32 
 
 		 648 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  26.32 
 
 		 648 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  23.72 
 
 		 707 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.1 
 
 		 837 aa  127  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  32.08 
 
 		 735 aa  126  9e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.01 
 
 		 858 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.83 
 
 		 673 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  29.64 
 
 		 787 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  30.33 
 
 		 742 aa  123  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 1032 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.42 
 
 		 741 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.95 
 
 		 825 aa  121  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  28.9 
 
 		 829 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  29.6 
 
 		 845 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.72 
 
 		 830 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  24.69 
 
 		 762 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  29.03 
 
 		 786 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  24.33 
 
 		 666 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.81 
 
 		 785 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.09 
 
 		 773 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  26.71 
 
 		 758 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  28.16 
 
 		 786 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  27.01 
 
 		 787 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0754  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.09 
 
 		 587 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.643559  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  28.77 
 
 		 706 aa  116  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  28.77 
 
 		 714 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  25.67 
 
 		 668 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  28.97 
 
 		 900 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.67 
 
 		 715 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.53 
 
 		 718 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 		 669 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.22 
 
 		 829 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.73 
 
 		 742 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.77 
 
 		 768 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  30.04 
 
 		 1075 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  27.61 
 
 		 751 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  27.76 
 
 		 725 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  27.99 
 
 		 759 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.9 
 
 		 781 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 760 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.6 
 
 		 896 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.3 
 
 		 772 aa  113  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  24.92 
 
 		 620 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 		 724 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  28.84 
 
 		 1232 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.8 
 
 		 795 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  28.23 
 
 		 735 aa  112  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.01 
 
 		 747 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.27 
 
 		 670 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  30.87 
 
 		 768 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.94 
 
 		 786 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.67 
 
 		 828 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  30.95 
 
 		 726 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.57 
 
 		 802 aa  111  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.49 
 
 		 754 aa  111  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  29.83 
 
 		 720 aa  111  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.36 
 
 		 849 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.72 
 
 		 833 aa  110  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  27.3 
 
 		 793 aa  110  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.66 
 
 		 751 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  27.76 
 
 		 787 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  27.76 
 
 		 787 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  27.76 
 
 		 787 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.66 
 
 		 747 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.16 
 
 		 1023 aa  110  7.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  27.76 
 
 		 787 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  27.76 
 
 		 787 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.18 
 
 		 831 aa  110  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  27.76 
 
 		 787 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  27.76 
 
 		 787 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 826 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  29.41 
 
 		 787 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  29.49 
 
 		 720 aa  110  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.21 
 
 		 765 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.23 
 
 		 737 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0127  DNA helicase II  29.28 
 
 		 646 aa  110  1e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.889231  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  30.79 
 
 		 688 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  27.45 
 
 		 809 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.71 
 
 		 694 aa  109  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.76 
 
 		 794 aa  109  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5331  UvrD/REP helicase  27.57 
 
 		 822 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.34 
 
 		 753 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.62 
 
 		 755 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10120  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.07 
 
 		 841 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.48 
 
 		 725 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.78 
 
 		 730 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.34 
 
 		 753 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.56 
 
 		 816 aa  109  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.19 
 
 		 858 aa  109  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  29.29 
 
 		 786 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  30.24 
 
 		 746 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  27.67 
 
 		 771 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.41 
 
 		 783 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.71 
 
 		 780 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.34 
 
 		 747 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  28.97 
 
 		 743 aa  108  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  31.53 
 
 		 731 aa  108  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>