130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2163 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2163  putative DNA helicase  100 
 
 		 518 aa  1063    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3510  superfamily I DNA/RNA helicase  55.31 
 
 		 600 aa  549  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3757  putative DNA helicase  41.9 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  34.84 
 
 		 498 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  33.07 
 
 		 647 aa  209  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  31.47 
 
 		 645 aa  207  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  32.26 
 
 		 536 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  31.66 
 
 		 486 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4241  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.74 
 
 		 555 aa  183  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3759  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.97 
 
 		 500 aa  177  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  29.76 
 
 		 481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.37 
 
 		 505 aa  171  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  29.9 
 
 		 503 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  30.83 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.75 
 
 		 519 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  30.59 
 
 		 493 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  27.34 
 
 		 1658 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  29.13 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  30.39 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  30.39 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  29.86 
 
 		 493 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  28.74 
 
 		 499 aa  157  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1452  hypothetical protein  29.26 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.12 
 
 		 513 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4323  hypothetical protein  29.3 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0879  hypothetical protein  29.26 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  27.62 
 
 		 500 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1708  UvrD/REP helicase  24.52 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0661  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 708 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612479  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  25.72 
 
 		 729 aa  57.4  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  25.55 
 
 		 715 aa  57.4  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.81 
 
 		 747 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5077  UvrD/REP helicase  25.58 
 
 		 600 aa  54.3  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935976  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  29.38 
 
 		 774 aa  53.9  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2179  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 809 aa  53.9  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.577747  normal  0.847748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  24.81 
 
 		 678 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.15 
 
 		 751 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  27.15 
 
 		 753 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.15 
 
 		 747 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.27 
 
 		 758 aa  52.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0961  UvrD/REP helicase  25.71 
 
 		 679 aa  52.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  27.76 
 
 		 668 aa  52.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.15 
 
 		 753 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.15 
 
 		 751 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.15 
 
 		 747 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  27.15 
 
 		 751 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.3 
 
 		 741 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  31.05 
 
 		 1150 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.15 
 
 		 751 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.15 
 
 		 753 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  24.67 
 
 		 726 aa  51.2  0.00005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  24.28 
 
 		 662 aa  50.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.28 
 
 		 662 aa  50.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  25.47 
 
 		 1101 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1726  UvrD/REP helicase  22.41 
 
 		 593 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1050  UvrD/REP helicase  36.25 
 
 		 597 aa  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.66 
 
 		 686 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  23.55 
 
 		 666 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  22.44 
 
 		 657 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  30.89 
 
 		 1128 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2302  UvrD/REP helicase  24.16 
 
 		 829 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556709  normal  0.916479 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  22.43 
 
 		 702 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  21.26 
 
 		 643 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.1 
 
 		 785 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  31.97 
 
 		 1108 aa  47.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  29.17 
 
 		 735 aa  47.8  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.57 
 
 		 737 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  26.71 
 
 		 638 aa  47.4  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.6 
 
 		 849 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  24.69 
 
 		 672 aa  47.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.58 
 
 		 741 aa  47  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4281  UvrD/REP helicase  23.4 
 
 		 606 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2745  UvrD/REP helicase  32.32 
 
 		 687 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223218  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 1421 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  21.71 
 
 		 603 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3142  UvrD/REP helicase  31 
 
 		 687 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345803  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3335  UvrD/REP helicase  32.32 
 
 		 694 aa  47  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.667259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  36.59 
 
 		 700 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.15 
 
 		 765 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  36 
 
 		 770 aa  46.2  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 697 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.57 
 
 		 730 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.57 
 
 		 730 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.61 
 
 		 1228 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  24.92 
 
 		 728 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0548  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 745 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  22.11 
 
 		 717 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.41 
 
 		 768 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2701  UvrD/REP helicase  34.74 
 
 		 686 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311884  normal  0.28531 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  23.66 
 
 		 726 aa  45.1  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  33.06 
 
 		 759 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0782  ATP-dependent DNA helicase  27.04 
 
 		 675 aa  45.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  35.62 
 
 		 669 aa  45.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36 
 
 		 829 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  32.39 
 
 		 681 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  32.61 
 
 		 816 aa  44.7  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  34.67 
 
 		 892 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0402  UvrD/REP helicase  36.36 
 
 		 712 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.05 
 
 		 658 aa  44.7  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.52 
 
 		 732 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>