110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59830 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0879  hypothetical protein  65.62 
 
 		 485 aa  661    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1452  hypothetical protein  65.77 
 
 		 487 aa  664    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  100 
 
 		 493 aa  1024    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  98.17 
 
 		 493 aa  1006    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  49.38 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  43.91 
 
 		 481 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  44.1 
 
 		 509 aa  364  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  35.14 
 
 		 645 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  35.57 
 
 		 647 aa  242  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3759  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.33 
 
 		 500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4241  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  34.58 
 
 		 555 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  32.88 
 
 		 519 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  31.55 
 
 		 1658 aa  204  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  30.51 
 
 		 498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3510  superfamily I DNA/RNA helicase  30.25 
 
 		 600 aa  173  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2163  putative DNA helicase  29.86 
 
 		 518 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  28.4 
 
 		 486 aa  154  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  29.92 
 
 		 536 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3757  putative DNA helicase  28.29 
 
 		 501 aa  136  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.27 
 
 		 513 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  28.48 
 
 		 499 aa  124  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  28.28 
 
 		 499 aa  123  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.51 
 
 		 505 aa  123  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  28.05 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4323  hypothetical protein  28.96 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  26.65 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  26.65 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0793  hypothetical protein  22.82 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1708  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 		 695 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  23.62 
 
 		 712 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  26.18 
 
 		 676 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  30.77 
 
 		 787 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  23.28 
 
 		 708 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  24.62 
 
 		 774 aa  53.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  24.4 
 
 		 678 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  23.27 
 
 		 717 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  27.78 
 
 		 765 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0732  UvrD/REP helicase  25.43 
 
 		 929 aa  52  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  35 
 
 		 700 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  37.89 
 
 		 1183 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12091  UvrD/REP helicase subunit B  26.45 
 
 		 1208 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  22.69 
 
 		 648 aa  49.7  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  22.69 
 
 		 648 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2289  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  44 
 
 		 542 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121386  normal  0.561686 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  22.6 
 
 		 508 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  23.89 
 
 		 710 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12101  UvrD/REP helicase subunit B  20.85 
 
 		 1208 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4241  UvrD/REP helicase  22.65 
 
 		 907 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000158675 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6795  UvrD/REP helicase  38.89 
 
 		 571 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.357242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  26.73 
 
 		 786 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  26.91 
 
 		 783 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  26.1 
 
 		 829 aa  48.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  31.58 
 
 		 690 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  34.07 
 
 		 1203 aa  47.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0641  UvrD/REP helicase  22.42 
 
 		 602 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1726  UvrD/REP helicase  23.86 
 
 		 593 aa  47.4  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  41.67 
 
 		 768 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  22.17 
 
 		 699 aa  47  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  27.34 
 
 		 1060 aa  47  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_002620  TC0490  UvrD/REP helicase family protein  26.25 
 
 		 890 aa  47  0.0009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  33.68 
 
 		 725 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  33.88 
 
 		 630 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.01 
 
 		 709 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3907  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.18 
 
 		 1139 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0574999  normal  0.0165259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  24.58 
 
 		 729 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2967  UvrD/REP helicase  24.52 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  27.53 
 
 		 1074 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 		 786 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1579  UvrD/REP helicase  32.18 
 
 		 989 aa  45.8  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3743  UvrD/REP helicase  29.27 
 
 		 702 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0471553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0579  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.18 
 
 		 1085 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  33.7 
 
 		 1226 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  33.61 
 
 		 706 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  28.75 
 
 		 724 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  25.27 
 
 		 668 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  34.83 
 
 		 655 aa  44.7  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  23.64 
 
 		 684 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  25.58 
 
 		 789 aa  44.7  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03797  DNA helicase and DNA-dependent ATPase (Eurofung)  33.85 
 
 		 997 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0934471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  23.16 
 
 		 706 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.79 
 
 		 876 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0599  UvrD/REP helicase  31.07 
 
 		 697 aa  44.3  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  34.48 
 
 		 728 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2352  UvrD/REP helicase  31.96 
 
 		 920 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0871  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.41 
 
 		 1180 aa  43.9  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  38.57 
 
 		 728 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  38.57 
 
 		 728 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  29.36 
 
 		 759 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2966  exonuclease V subunit beta  29.41 
 
 		 1180 aa  43.9  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3140  exonuclease V subunit beta  29.41 
 
 		 1180 aa  43.9  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0895  exonuclease V subunit beta  29.41 
 
 		 1180 aa  43.9  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.861993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3042  exonuclease V subunit beta  29.41 
 
 		 1180 aa  43.9  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1511  UvrD/REP helicase  34.29 
 
 		 573 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.487565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4085  exonuclease V subunit beta  29.41 
 
 		 1180 aa  43.9  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5176  UvrD/REP helicase  34.29 
 
 		 573 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02668  exonuclease V (RecBCD complex), beta subunit  29.41 
 
 		 1180 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501353  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3223  UvrD/REP helicase  32.56 
 
 		 591 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5440  UvrD/REP helicase  38.1 
 
 		 1051 aa  43.9  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202358 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2967  exonuclease V subunit beta  29.41 
 
 		 1170 aa  43.9  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.483472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1045  UvrD/REP helicase  35.44 
 
 		 587 aa  43.9  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52657  normal  0.201232 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>