More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0641 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0641  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 602 aa  1248    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  24.8 
 
 		 712 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.04 
 
 		 743 aa  107  5e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 		 754 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3526  hypothetical protein  23.56 
 
 		 617 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.396406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.33 
 
 		 756 aa  104  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  23.93 
 
 		 704 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  23.59 
 
 		 1050 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  23.69 
 
 		 717 aa  102  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1890  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.32 
 
 		 540 aa  100  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  25.58 
 
 		 744 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  23.65 
 
 		 648 aa  99.8  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  23.65 
 
 		 648 aa  99.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  22.34 
 
 		 762 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1845  UvrD/REP helicase  22.6 
 
 		 620 aa  98.6  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.37 
 
 		 713 aa  98.2  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  23.86 
 
 		 688 aa  98.2  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.93 
 
 		 757 aa  97.8  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.72 
 
 		 741 aa  97.4  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.94 
 
 		 747 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.94 
 
 		 751 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.94 
 
 		 751 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  24.94 
 
 		 753 aa  97.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  24.94 
 
 		 751 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.94 
 
 		 747 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.94 
 
 		 751 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.13 
 
 		 753 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.13 
 
 		 753 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  25.9 
 
 		 731 aa  94.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  24.46 
 
 		 723 aa  94.7  5e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.03 
 
 		 715 aa  94.7  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.62 
 
 		 747 aa  94.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  26.03 
 
 		 722 aa  94.7  5e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.62 
 
 		 765 aa  94.4  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  22.85 
 
 		 708 aa  94.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.16 
 
 		 785 aa  94.4  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.16 
 
 		 732 aa  94  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  26.73 
 
 		 681 aa  93.6  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  27.46 
 
 		 1132 aa  93.2  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.16 
 
 		 729 aa  93.2  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5519  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.63 
 
 		 669 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.21 
 
 		 730 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  24.26 
 
 		 682 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.21 
 
 		 730 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  22.83 
 
 		 620 aa  92.8  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  22.96 
 
 		 684 aa  92.8  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.3 
 
 		 669 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.9 
 
 		 742 aa  92  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.3 
 
 		 669 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.21 
 
 		 731 aa  91.7  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.3 
 
 		 669 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  25.62 
 
 		 732 aa  92  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0075  ATP-dependent DNA helicase RepA  26.63 
 
 		 669 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0661  UvrD/REP helicase  22.75 
 
 		 708 aa  91.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612479  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.3 
 
 		 669 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 726 aa  91.3  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  24.33 
 
 		 701 aa  91.3  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  25.51 
 
 		 625 aa  90.5  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  25.53 
 
 		 671 aa  90.5  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.63 
 
 		 669 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  24.61 
 
 		 723 aa  90.5  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.64 
 
 		 787 aa  90.1  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.69 
 
 		 788 aa  90.5  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  25.64 
 
 		 787 aa  90.1  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.7 
 
 		 738 aa  90.1  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  26.63 
 
 		 738 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  25.64 
 
 		 787 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  24.17 
 
 		 1075 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.61 
 
 		 671 aa  90.1  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  25.64 
 
 		 846 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.6 
 
 		 745 aa  89.4  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.23 
 
 		 1228 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.04 
 
 		 759 aa  89  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0253  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.99 
 
 		 669 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  24.72 
 
 		 738 aa  89.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.32 
 
 		 737 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.18 
 
 		 669 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.91 
 
 		 672 aa  89  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  25.26 
 
 		 790 aa  88.6  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  25.87 
 
 		 786 aa  88.6  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  25.87 
 
 		 787 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  25.13 
 
 		 720 aa  88.6  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.78 
 
 		 706 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  24.01 
 
 		 700 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.76 
 
 		 748 aa  88.6  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.8 
 
 		 690 aa  88.2  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  25.07 
 
 		 666 aa  88.2  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  25.13 
 
 		 720 aa  88.2  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  25.87 
 
 		 840 aa  88.2  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  23.62 
 
 		 787 aa  87.8  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  24.02 
 
 		 746 aa  87.4  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1307  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  24.19 
 
 		 688 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000490806 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  27.91 
 
 		 666 aa  87  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.93 
 
 		 725 aa  87  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.61 
 
 		 758 aa  87  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  25.58 
 
 		 742 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.45 
 
 		 711 aa  86.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  23.36 
 
 		 715 aa  86.3  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8359  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.7 
 
 		 689 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364158  normal  0.650565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  24.29 
 
 		 726 aa  86.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>