More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1544 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1544  UvrD/REP helicase  100 
 
 
808 aa  1676    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0101134  unclonable  0.000000000582893 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  23.14 
 
 
797 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  23.42 
 
 
630 aa  106  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  23.14 
 
 
797 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  24.61 
 
 
732 aa  105  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  24.14 
 
 
1232 aa  104  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  24.86 
 
 
795 aa  104  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 
757 aa  103  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  24.72 
 
 
795 aa  103  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  25 
 
 
678 aa  102  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  24.31 
 
 
798 aa  102  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.54 
 
 
797 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.79 
 
 
802 aa  100  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3574  UvrD/REP helicase  24.34 
 
 
646 aa  100  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  27.61 
 
 
1110 aa  99.4  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  28 
 
 
733 aa  99.4  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  26.12 
 
 
816 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.77 
 
 
781 aa  99  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 
790 aa  98.6  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28 
 
 
748 aa  98.6  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  27.43 
 
 
1110 aa  97.8  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.46 
 
 
858 aa  96.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.06 
 
 
833 aa  97.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.64 
 
 
786 aa  97.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 
797 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.95 
 
 
659 aa  97.1  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.82 
 
 
858 aa  97.1  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  24.15 
 
 
731 aa  97.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  28.66 
 
 
741 aa  96.3  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.49 
 
 
729 aa  95.5  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  29.45 
 
 
724 aa  95.9  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  24.83 
 
 
726 aa  95.5  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  29.28 
 
 
1032 aa  95.1  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  26.48 
 
 
787 aa  95.1  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  28.93 
 
 
741 aa  94.4  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  22.75 
 
 
728 aa  94  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 
778 aa  94  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  23.3 
 
 
765 aa  94  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.79 
 
 
694 aa  93.6  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.21 
 
 
806 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  26.81 
 
 
812 aa  92  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  25.79 
 
 
1076 aa  92  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 
655 aa  92  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  26.74 
 
 
705 aa  91.3  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  23.22 
 
 
725 aa  91.3  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  27.33 
 
 
728 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 
735 aa  91.3  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  27.33 
 
 
728 aa  91.3  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.31 
 
 
768 aa  91.3  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  23.1 
 
 
757 aa  91.3  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.84 
 
 
662 aa  90.5  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  22.97 
 
 
726 aa  90.5  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  26.18 
 
 
1074 aa  90.1  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.61 
 
 
932 aa  90.5  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.51 
 
 
755 aa  90.5  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  24.07 
 
 
807 aa  90.9  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.73 
 
 
794 aa  89.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.92 
 
 
690 aa  89.7  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.1 
 
 
1155 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  23.46 
 
 
728 aa  90.1  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.24 
 
 
892 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  27.49 
 
 
727 aa  89  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  26.73 
 
 
742 aa  89  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.29 
 
 
671 aa  89  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  25.79 
 
 
721 aa  89  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  29.14 
 
 
714 aa  88.2  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  27.24 
 
 
779 aa  88.2  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.404442 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.4 
 
 
685 aa  88.2  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  23.75 
 
 
639 aa  87.8  7e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  23.1 
 
 
688 aa  87.4  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  27.24 
 
 
754 aa  87.8  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.27 
 
 
732 aa  87.8  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.45 
 
 
756 aa  87.8  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.61 
 
 
747 aa  87  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.65 
 
 
730 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.38 
 
 
786 aa  87.4  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.97 
 
 
737 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3622  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.37 
 
 
1135 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.57 
 
 
837 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.65 
 
 
730 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  23.69 
 
 
714 aa  87  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  22.78 
 
 
755 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  24.03 
 
 
634 aa  86.3  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  24.73 
 
 
676 aa  86.3  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.66 
 
 
747 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  23.97 
 
 
724 aa  86.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  24.69 
 
 
1076 aa  86.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.33 
 
 
713 aa  86.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.46 
 
 
663 aa  86.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1084  UvrD/REP helicase  24.31 
 
 
789 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.43 
 
 
1200 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.66 
 
 
753 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.66 
 
 
753 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.48 
 
 
829 aa  86.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2436  UvrD/REP helicase  28.7 
 
 
778 aa  86.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0016628  normal  0.650689 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  28.96 
 
 
672 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  27.46 
 
 
725 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.66 
 
 
751 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.91 
 
 
817 aa  85.5  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.46 
 
 
773 aa  85.9  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>