More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1823 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
213 aa  424  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.03 
 
 
836 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
927 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 
602 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
543 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  34.84 
 
 
1138 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  39.42 
 
 
162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  41.53 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  40.97 
 
 
623 aa  108  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  35.07 
 
 
573 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 
366 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  36.43 
 
 
1276 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  40.29 
 
 
1694 aa  104  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
329 aa  104  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.14 
 
 
1056 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  38.58 
 
 
1007 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 
344 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 
512 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.33 
 
 
397 aa  101  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  38.17 
 
 
361 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  38.35 
 
 
562 aa  101  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.18 
 
 
560 aa  101  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  40.29 
 
 
4079 aa  101  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.12 
 
 
784 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 
1276 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
279 aa  99  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  35.17 
 
 
1979 aa  98.6  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
1069 aa  98.6  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  34.31 
 
 
564 aa  97.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 
1049 aa  96.7  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 
3560 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
1192 aa  96.3  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.35 
 
 
818 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
523 aa  95.9  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
711 aa  95.5  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
4489 aa  95.1  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
1094 aa  95.1  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
716 aa  94.7  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30.41 
 
 
576 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  38.06 
 
 
417 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
699 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  40.3 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 
388 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 
388 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.93 
 
 
784 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  37.88 
 
 
390 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
452 aa  93.2  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
409 aa  92.4  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.29 
 
 
1056 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.5 
 
 
988 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
250 aa  91.7  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
254 aa  91.7  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  30.12 
 
 
398 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.62 
 
 
707 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  32.2 
 
 
743 aa  90.5  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.33 
 
 
314 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
465 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.09 
 
 
1022 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
486 aa  89.4  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
280 aa  89  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  35.54 
 
 
191 aa  88.6  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
3035 aa  88.6  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 
162 aa  88.6  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.25 
 
 
462 aa  88.2  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  41.09 
 
 
662 aa  88.6  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.69 
 
 
632 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  30.07 
 
 
635 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  31.85 
 
 
252 aa  87  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
273 aa  87  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.33 
 
 
730 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.06 
 
 
810 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.55 
 
 
465 aa  85.9  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
352 aa  85.9  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.81 
 
 
196 aa  86.3  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.11 
 
 
545 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
465 aa  85.9  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
245 aa  85.5  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  28.24 
 
 
135 aa  85.5  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.35 
 
 
292 aa  85.5  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 
435 aa  85.1  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.71 
 
 
297 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
589 aa  85.1  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.71 
 
 
297 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 
617 aa  84  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
306 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
878 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1816  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.88 
 
 
174 aa  84  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
713 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 
409 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
523 aa  82.8  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  27.65 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  27.63 
 
 
582 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 
363 aa  82.4  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
414 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>