More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5360 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  98.1 
 
 		 632 aa  1239    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  72.23 
 
 		 627 aa  850    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 632 aa  1258    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  89.08 
 
 		 632 aa  1120    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  71.72 
 
 		 887 aa  571  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 766 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.17 
 
 		 510 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.475252  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.26 
 
 		 510 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 		 510 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.91 
 
 		 506 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1754  bacteriophytochrome  52.47 
 
 		 538 aa  261  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478191  normal  0.160792 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0666  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  54.8 
 
 		 579 aa  260  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.74861  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2190  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.24 
 
 		 532 aa  261  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.62 
 
 		 499 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0760832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 766 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2870  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.45 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267269  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  38.24 
 
 		 1053 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0386  two component sensor kinase  51.16 
 
 		 495 aa  248  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0712602  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.27 
 
 		 504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.07 
 
 		 651 aa  243  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 774 aa  243  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1783  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.83 
 
 		 494 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.992798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0150  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.44 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1667  histidine kinase  47.47 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0824698 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1341  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.16 
 
 		 495 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0234409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.14 
 
 		 1036 aa  220  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0053  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 		 796 aa  212  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 991 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  31.26 
 
 		 626 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 798 aa  187  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 1128 aa  187  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 611 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 611 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 1562 aa  185  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  33.94 
 
 		 792 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 803 aa  179  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 430 aa  177  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758672 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0386  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  46.5 
 
 		 685 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 1043 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 1177 aa  175  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0401  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with MHYT sensor  46.75 
 
 		 687 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  30.26 
 
 		 1020 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 683 aa  172  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 798 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 761 aa  170  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2727  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 576 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49140  GGDEF domain protein  41.39 
 
 		 689 aa  168  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1122 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 960 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2990  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 1253 aa  167  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450084  normal  0.707823 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 929 aa  167  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2427  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  49.49 
 
 		 683 aa  166  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 1383 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.62 
 
 		 693 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 984 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 713 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  43.82 
 
 		 627 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  43.82 
 
 		 627 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  43.82 
 
 		 627 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  43.82 
 
 		 627 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  43.82 
 
 		 627 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 1118 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 1118 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  43.82 
 
 		 627 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42220  membrane sensor domain-containing protein  45.53 
 
 		 685 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 416 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0510  hypothetical protein  45.97 
 
 		 701 aa  164  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0522945 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 807 aa  164  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  43.45 
 
 		 627 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1602  histidine kinase  40.24 
 
 		 582 aa  163  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3581  GGDEF domain-containing protein  42.8 
 
 		 695 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 508 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2867  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.96 
 
 		 591 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6743  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  47.54 
 
 		 693 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4460  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.86 
 
 		 709 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200253  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.8 
 
 		 695 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3579  ggdef domain/eal domain protein  42.15 
 
 		 691 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3749  ggdef domain/eal domain-containing protein  42.15 
 
 		 699 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.338574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3652  ggdef domain/eal domain protein  42.15 
 
 		 699 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.117514 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6267  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  47.13 
 
 		 693 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.57074  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3580  ggdef domain/eal domain protein  42.15 
 
 		 699 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3579  hypothetical protein  45.53 
 
 		 685 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0227937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3686  ggdef domain/eal domain-containing protein  42.15 
 
 		 699 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0580402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2333  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.96 
 
 		 695 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.86 
 
 		 689 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 896 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3631  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 361 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.991332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 575 aa  159  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 		 966 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2620  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and MHYT sensor(s)  33.97 
 
 		 799 aa  158  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 1064 aa  158  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 1068 aa  157  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 835 aa  157  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1760  histidine kinase  39.6 
 
 		 563 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1563  putative integral membrane sensor protein  47.13 
 
 		 367 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3702  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.08 
 
 		 692 aa  154  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.561666  normal  0.977889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 881 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>