119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2857 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  100 
 
 
270 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  47.78 
 
 
272 aa  254  7e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  47.21 
 
 
269 aa  247  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  43.49 
 
 
268 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  42.44 
 
 
269 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.7 
 
 
286 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  37.91 
 
 
281 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.19 
 
 
274 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.13 
 
 
276 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  39.41 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  42.26 
 
 
265 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.45 
 
 
264 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40 
 
 
265 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.01 
 
 
281 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.45 
 
 
265 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  32.59 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  33.65 
 
 
272 aa  135  8e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  35.68 
 
 
424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  30.36 
 
 
289 aa  133  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  34.57 
 
 
415 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  35.39 
 
 
415 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.18 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.07 
 
 
415 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  36.1 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.08 
 
 
265 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.7 
 
 
265 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.64 
 
 
307 aa  122  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.64 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  29.15 
 
 
425 aa  120  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  27.65 
 
 
266 aa  116  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  33.8 
 
 
301 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  26.52 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  29.35 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  29.91 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.71 
 
 
269 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  30.18 
 
 
257 aa  106  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  30.18 
 
 
332 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.86 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  28.04 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.04 
 
 
266 aa  95.5  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  29.26 
 
 
254 aa  95.1  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  28.08 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.68 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  35.14 
 
 
152 aa  63.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  36.26 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  35.56 
 
 
312 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.61 
 
 
245 aa  55.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.29 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  25.16 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  30.54 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  36.52 
 
 
553 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  34.17 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  40 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  35.29 
 
 
568 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.17 
 
 
256 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.85 
 
 
228 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  36.19 
 
 
228 aa  52.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  36.19 
 
 
228 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  38.05 
 
 
251 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.65 
 
 
572 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  34.26 
 
 
225 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.51 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  35.24 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  31.65 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.65 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  36.52 
 
 
568 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.65 
 
 
229 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  36.51 
 
 
312 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  41.03 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  41.03 
 
 
232 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.14 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.51 
 
 
230 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.15 
 
 
240 aa  49.3  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.06 
 
 
252 aa  49.3  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  37.78 
 
 
225 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0525  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C-like  34.91 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.618523  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  38.1 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  29.17 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.79 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  29.5 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  43.24 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.15 
 
 
245 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.17 
 
 
247 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  38.14 
 
 
670 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  29.13 
 
 
1536 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  43.24 
 
 
224 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  32.82 
 
 
228 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  30.58 
 
 
242 aa  45.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  31.25 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1478  hypothetical protein  27.59 
 
 
323 aa  45.8  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00968841  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  29.2 
 
 
1475 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.2 
 
 
1475 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  41.89 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  41.89 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.97 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.19 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.19 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.99 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.24 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2633  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.78 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>