85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4894 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  100 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  100 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  99.58 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  85.14 
 
 		 228 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  82.74 
 
 		 227 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  75.32 
 
 		 247 aa  356  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  65.37 
 
 		 235 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  63.96 
 
 		 224 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  65.94 
 
 		 229 aa  294  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  65.77 
 
 		 242 aa  294  9e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  65.94 
 
 		 229 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  65.79 
 
 		 229 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  63.84 
 
 		 227 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  64.86 
 
 		 224 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  63.39 
 
 		 227 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  66.81 
 
 		 227 aa  288  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  66.97 
 
 		 225 aa  288  7e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  63.56 
 
 		 228 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  64.76 
 
 		 230 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  63.11 
 
 		 228 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  62.11 
 
 		 228 aa  279  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  62.22 
 
 		 228 aa  278  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  61.4 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  61.23 
 
 		 228 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  65.2 
 
 		 229 aa  272  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  62.39 
 
 		 228 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  61.9 
 
 		 229 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2633  glutamate synthase alpha subunit domain protein  58.44 
 
 		 235 aa  248  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  56.39 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  57.71 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  51.3 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  52.44 
 
 		 225 aa  228  8e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  33.01 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  30.47 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.14 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  28.35 
 
 		 670 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.55 
 
 		 659 aa  55.8  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.49 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  37.74 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  26.5 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.19 
 
 		 304 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.5 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  27.27 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.16 
 
 		 646 aa  51.2  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.55 
 
 		 572 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  25 
 
 		 425 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.64 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  25.93 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  31.07 
 
 		 424 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  25.93 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  36 
 
 		 415 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  31.01 
 
 		 1498 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  35.34 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.26 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.55 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.67 
 
 		 415 aa  48.9  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.05 
 
 		 266 aa  48.5  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  26.34 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.45 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  25.36 
 
 		 332 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  23.81 
 
 		 415 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.04 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  29.11 
 
 		 568 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.62 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  24.81 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.86 
 
 		 274 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  24.81 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  36.11 
 
 		 272 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  36.99 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.23 
 
 		 1518 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  35.19 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  40.26 
 
 		 553 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  32.32 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  23.48 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  27.55 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  26.36 
 
 		 301 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  26.25 
 
 		 312 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  26.29 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.71 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.96 
 
 		 1499 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  29.44 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  34.07 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  22.75 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  26.64 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.12 
 
 		 251 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>