253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1198 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  100 
 
 		 152 aa  291  3e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  35.14 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  34.81 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.88 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.52 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  36.3 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  38.76 
 
 		 269 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  35.81 
 
 		 301 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  30.99 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  37.9 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  36.72 
 
 		 424 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.2 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  35.2 
 
 		 272 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  34.38 
 
 		 425 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4114  glutamate synthase subunit alpha  34.65 
 
 		 1461 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000785816 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 1487 aa  53.9  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.77 
 
 		 304 aa  52.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  36.63 
 
 		 1487 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  33.59 
 
 		 266 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  37.62 
 
 		 1486 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03077  glutamate synthase, large subunit  36.63 
 
 		 1517 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.427677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0495  Glutamate synthase (ferredoxin)  36.63 
 
 		 1517 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3700  glutamate synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 1486 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03028  hypothetical protein  36.63 
 
 		 1517 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.403109  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  39.39 
 
 		 254 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0488  glutamate synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 1522 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.690727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3508  glutamate synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 1517 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3405  glutamate synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 1486 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3558  glutamate synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 1486 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4535  glutamate synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 1517 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  35.64 
 
 		 1486 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  35.64 
 
 		 1524 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.72 
 
 		 276 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.25 
 
 		 291 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  39.47 
 
 		 225 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.83 
 
 		 415 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  31.78 
 
 		 272 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  35.96 
 
 		 294 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  35.35 
 
 		 228 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  32.61 
 
 		 1482 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  35.64 
 
 		 1486 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 1486 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  35.64 
 
 		 1486 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  37 
 
 		 1474 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.64 
 
 		 1521 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 1487 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.66 
 
 		 1487 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  30.82 
 
 		 332 aa  50.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  36.36 
 
 		 228 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  32.32 
 
 		 1499 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  40.78 
 
 		 568 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  33.66 
 
 		 1460 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3656  glutamate synthase subunit alpha  33.66 
 
 		 1516 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.166032 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.36 
 
 		 228 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3213  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.56 
 
 		 1542 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  32.32 
 
 		 1499 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  34.65 
 
 		 1485 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1686  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.85 
 
 		 1537 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.57 
 
 		 1550 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.62 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  32.76 
 
 		 289 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.19 
 
 		 1519 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  44.93 
 
 		 415 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  35.64 
 
 		 1482 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  34.65 
 
 		 1535 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  34.65 
 
 		 1485 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 1482 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  32.62 
 
 		 1482 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  39.25 
 
 		 568 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  34.34 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  33.94 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  33.66 
 
 		 1482 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34.34 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  36.57 
 
 		 415 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  39.81 
 
 		 553 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  32.12 
 
 		 1482 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  32.61 
 
 		 1482 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  32.61 
 
 		 1482 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5773  glutamate synthase subunit alpha  33.66 
 
 		 1481 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.28 
 
 		 286 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  35.64 
 
 		 1487 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  33.96 
 
 		 1482 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  32.12 
 
 		 1482 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  32.85 
 
 		 1482 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  32.12 
 
 		 1462 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1691  glutamate synthase (NADH) large subunit  35.29 
 
 		 1519 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103385  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1178  glutamate synthase subunit alpha  32.12 
 
 		 1482 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  32.12 
 
 		 1462 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  35.64 
 
 		 1487 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  35.64 
 
 		 1488 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.82 
 
 		 1525 aa  47.4  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.65 
 
 		 1527 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1346  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.45 
 
 		 1520 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.92 
 
 		 1531 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.84 
 
 		 1519 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  31.54 
 
 		 1465 aa  47  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  35.29 
 
 		 255 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66570  glutamate synthase subunit alpha  32.67 
 
 		 1481 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  33.66 
 
 		 1507 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  33.66 
 
 		 1482 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.213876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>