118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0867 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 		 256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  96.09 
 
 		 263 aa  502  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  96.09 
 
 		 256 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  80.86 
 
 		 256 aa  436  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  70.31 
 
 		 261 aa  372  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  50 
 
 		 247 aa  268  8e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  52.96 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  52.38 
 
 		 246 aa  265  7e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  52.19 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  47.79 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  47.79 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  48.02 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  49.39 
 
 		 240 aa  235  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  47.41 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  45.38 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  45.24 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  48 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  46.03 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  45.16 
 
 		 251 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  44.14 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  44.94 
 
 		 242 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  43.46 
 
 		 281 aa  205  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  43.65 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  46 
 
 		 248 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  44.58 
 
 		 256 aa  201  7e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  45.49 
 
 		 256 aa  201  8e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  42.17 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  44.58 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  41.13 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  33.33 
 
 		 670 aa  149  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  43.01 
 
 		 646 aa  125  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  41.45 
 
 		 659 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  31.25 
 
 		 568 aa  113  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  30.83 
 
 		 568 aa  113  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  30.77 
 
 		 553 aa  102  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.44 
 
 		 572 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  31.35 
 
 		 771 aa  75.1  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  30.05 
 
 		 771 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.49 
 
 		 381 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.88 
 
 		 635 aa  68.6  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.33 
 
 		 794 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.03 
 
 		 777 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.17 
 
 		 777 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.46 
 
 		 777 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 		 776 aa  62.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.46 
 
 		 793 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  35.42 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  27.19 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  36.11 
 
 		 424 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  24.44 
 
 		 1524 aa  55.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.17 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  27.95 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.7 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  34.17 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  30.48 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  29.78 
 
 		 1473 aa  52  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  27.48 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  30.08 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  30.26 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  30.89 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  26.95 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  35.48 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  28.85 
 
 		 425 aa  50.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2633  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.91 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  26.43 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.29 
 
 		 1530 aa  49.3  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  23.91 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  26.38 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.37 
 
 		 1525 aa  48.9  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  24.7 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  34.26 
 
 		 415 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.03 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  27.61 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  28 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.11 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.45 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3213  Glutamate synthase (ferredoxin)  22.5 
 
 		 1542 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  24.21 
 
 		 1546 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.63 
 
 		 1531 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.64 
 
 		 1469 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  33.72 
 
 		 320 aa  47  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  23.53 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  25.73 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.73 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.4 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  25.77 
 
 		 1554 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  25.93 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5698  glutamate synthase (ferredoxin)  24.58 
 
 		 1514 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471666 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  33.03 
 
 		 272 aa  45.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.2 
 
 		 1512 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  31.21 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0854  glutamate synthase (ferredoxin)  26.54 
 
 		 1540 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265918  normal  0.188488 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  31.78 
 
 		 312 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  24.66 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.46 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.33 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.77 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  24.39 
 
 		 1519 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.36 
 
 		 1487 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  25.9 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.917164 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>