More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1482 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  41.7 
 
 
2126 aa  1078    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03077  glutamate synthase, large subunit  45.82 
 
 
1517 aa  1216    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.427677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0495  Glutamate synthase (ferredoxin)  45.89 
 
 
1517 aa  1217    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  47.13 
 
 
1486 aa  1285    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  48.01 
 
 
1481 aa  1301    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  42.33 
 
 
1542 aa  1112    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2965  glutamate synthase (large subunit) oxidoreductase protein  41.81 
 
 
1582 aa  1066    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0761  putative glutamate synthase, ferredoxin-dependent  40.07 
 
 
1535 aa  1064    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  46.88 
 
 
1486 aa  1256    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0007  glutamate synthase, large subunit  39.36 
 
 
1496 aa  1014    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  40.05 
 
 
1583 aa  1070    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  45.03 
 
 
1482 aa  1199    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5123  glutamate synthase, large subunit  47.43 
 
 
1481 aa  1297    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3216  glutamate synthase, large subunit  40.67 
 
 
1567 aa  1043    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0741  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.62 
 
 
1577 aa  1045    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.704994  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2736  glutamate synthase, large subunit  40.67 
 
 
1581 aa  1043    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  41.43 
 
 
2135 aa  1082    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0411  glutamate synthase subunit alpha  47.4 
 
 
1481 aa  1290    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  45.34 
 
 
1487 aa  1230    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0217  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.4 
 
 
1544 aa  1051    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.27 
 
 
1520 aa  1068    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.68 
 
 
1529 aa  1027    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3126  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.53 
 
 
1600 aa  1080    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2767  glutamate synthase subunit alpha  48.61 
 
 
1494 aa  1334    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2953  glutamine amidotransferase, class-II  41.57 
 
 
1596 aa  1084    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401719  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  41.6 
 
 
1562 aa  1082    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3718  glutamate synthase, large subunit  40.67 
 
 
1648 aa  1041    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1604  glutamate synthase (ferredoxin)  42.05 
 
 
1554 aa  1086    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.505347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  47.34 
 
 
1481 aa  1301    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  41.17 
 
 
1512 aa  1031    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  100 
 
 
1473 aa  3030    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  41.46 
 
 
1571 aa  1078    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3499  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.65 
 
 
1567 aa  1041    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0502  glutamate synthase (ferredoxin)  41.89 
 
 
1533 aa  1097    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.154267  normal  0.477392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  41.64 
 
 
1535 aa  1025    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0186  glutamate synthase, large subunit  40.84 
 
 
1533 aa  1084    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0326  glutamate synthase (ferredoxin)  40.45 
 
 
1533 aa  997    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.144966 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0033  glutamate synthase, large subunit  39.28 
 
 
1495 aa  1014    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.281504  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1957  glutamate synthase subunit alpha  47.12 
 
 
1493 aa  1295    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0683  glutamate synthase (ferredoxin)  41.28 
 
 
1580 aa  1064    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.146525  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  58.17 
 
 
1479 aa  1781    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1604  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.15 
 
 
1468 aa  1000    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  42.58 
 
 
1536 aa  1087    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  42.76 
 
 
1524 aa  1095    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3014  glutamate synthase, large subunit  40.74 
 
 
1624 aa  1045    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0817  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.04 
 
 
1535 aa  1087    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3013  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.61 
 
 
1518 aa  1087    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0945186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4531  glutamate synthase ferredoxin subunit  42.45 
 
 
1579 aa  1113    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688027  normal  0.696569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3176  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.59 
 
 
1546 aa  1116    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0251  glutamate synthase (NADPH) large subunit  40.57 
 
 
1511 aa  1023    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2933  glutamate synthase (ferredoxin)  40.63 
 
 
1577 aa  1049    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  46.99 
 
 
1481 aa  1288    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0761  glutamate synthase ferredoxin subunit  42.86 
 
 
1573 aa  1119    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220538  normal  0.186889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2395  glutamate synthase (ferredoxin)  40.5 
 
 
1586 aa  1035    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0791  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.84 
 
 
1580 aa  1075    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.116614  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0365  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.96 
 
 
1567 aa  1045    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.512142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  45.76 
 
 
1482 aa  1231    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0875  glutamate synthase ferredoxin subunit  41.95 
 
 
1582 aa  1104    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0619471  normal  0.609882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  48.61 
 
 
1483 aa  1320    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1138  glutamate synthase (ferredoxin)  41.52 
 
 
1587 aa  1092    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207382  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  45.2 
 
 
1487 aa  1225    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3263  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.94 
 
 
1631 aa  1040    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3680  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.7 
 
 
1535 aa  1118    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117206  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2626  glutamate synthase (ferredoxin)  41.16 
 
 
1585 aa  1069    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.77642  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  40.08 
 
 
1510 aa  1010    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2140  glutamate synthase (ferredoxin)  41.78 
 
 
1510 aa  1061    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697929  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2705  glutamate synthase (ferredoxin)  40.85 
 
 
1659 aa  1044    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.89 
 
 
1518 aa  1027    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5066  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.89 
 
 
1527 aa  1051    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0341  glutamate synthase (NADH) large subunit  43.98 
 
 
1489 aa  1115    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  45.63 
 
 
1488 aa  1234    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.47 
 
 
1574 aa  1081    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3776  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.89 
 
 
1512 aa  1065    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0466  glutamate synthase (ferredoxin)  41.11 
 
 
1546 aa  1070    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549913  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  45.03 
 
 
1482 aa  1199    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  45.03 
 
 
1482 aa  1197    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2763  glutamate synthase subunit alpha  48.54 
 
 
1491 aa  1326    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  45.02 
 
 
1482 aa  1211    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0302  glutamate synthase (NADPH) large subunit  42.12 
 
 
1509 aa  1000    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.466931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0321  glutamate synthase (ferredoxin)  40.71 
 
 
1567 aa  1044    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.917459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66570  glutamate synthase subunit alpha  47.75 
 
 
1481 aa  1304    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1407  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.99 
 
 
1489 aa  1065    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0818  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.24 
 
 
1506 aa  977    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1691  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.26 
 
 
1519 aa  1070    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0402  glutamate synthase (ferredoxin)  40.84 
 
 
1567 aa  1046    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0706  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.96 
 
 
1512 aa  1083    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.985465  normal  0.0881297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  44.96 
 
 
1482 aa  1197    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1078  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.61 
 
 
1513 aa  1065    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.706498  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  55.28 
 
 
1465 aa  1656    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1617  glutamate synthase (ferredoxin)  41.5 
 
 
1553 aa  1082    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0628  glutamate synthase (NADH) large subunit  41.74 
 
 
1533 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  40.82 
 
 
1516 aa  1015    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  42.2 
 
 
1519 aa  1086    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  45.68 
 
 
1483 aa  1217    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.89 
 
 
1518 aa  1027    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5154  glutamate synthase (NADH) large subunit  40.89 
 
 
1527 aa  1051    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.631687 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1007  glutamate synthase (ferredoxin)  40.44 
 
 
1533 aa  1047    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  40.88 
 
 
1518 aa  1029    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5698  glutamate synthase (ferredoxin)  40.91 
 
 
1514 aa  1054    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.471666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  47.56 
 
 
1482 aa  1293    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>