More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1100 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  60.04 
 
 		 568 aa  645    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  61.09 
 
 		 572 aa  677    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 		 553 aa  1114    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  59.36 
 
 		 568 aa  642    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.07 
 
 		 659 aa  318  1e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.77 
 
 		 646 aa  296  5e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  31.8 
 
 		 670 aa  263  6e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  37.44 
 
 		 245 aa  116  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  29.37 
 
 		 364 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  32.18 
 
 		 382 aa  108  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.26 
 
 		 240 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  31.6 
 
 		 256 aa  107  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.51 
 
 		 350 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  32.41 
 
 		 350 aa  107  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  33.7 
 
 		 355 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  40.88 
 
 		 242 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  37.97 
 
 		 252 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  38.46 
 
 		 250 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  32.66 
 
 		 245 aa  104  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  32.66 
 
 		 245 aa  104  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  40.11 
 
 		 264 aa  104  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  34.01 
 
 		 245 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  38.46 
 
 		 245 aa  104  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  31.02 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  27.32 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  26.87 
 
 		 371 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  32.02 
 
 		 263 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  30.77 
 
 		 256 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  28.57 
 
 		 261 aa  101  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.02 
 
 		 256 aa  101  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  31 
 
 		 350 aa  100  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  30.2 
 
 		 374 aa  100  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  30.67 
 
 		 373 aa  99.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  38.61 
 
 		 281 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  26.65 
 
 		 350 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  38.75 
 
 		 247 aa  99  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  29.41 
 
 		 363 aa  98.6  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  31.7 
 
 		 248 aa  98.2  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  26.87 
 
 		 361 aa  98.2  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  31.34 
 
 		 364 aa  97.4  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  36.67 
 
 		 246 aa  97.1  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  29.82 
 
 		 339 aa  96.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  28.05 
 
 		 364 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  40.22 
 
 		 251 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.58 
 
 		 247 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.26 
 
 		 251 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  31.67 
 
 		 368 aa  95.5  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.91 
 
 		 249 aa  93.6  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  32.96 
 
 		 246 aa  93.6  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  30.8 
 
 		 248 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  26.3 
 
 		 395 aa  92.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  28.47 
 
 		 378 aa  92  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  26.3 
 
 		 372 aa  92.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  26.13 
 
 		 369 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  28.83 
 
 		 359 aa  90.5  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  30 
 
 		 376 aa  89.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  27.59 
 
 		 376 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.64 
 
 		 248 aa  88.2  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  27.78 
 
 		 376 aa  87  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  23.96 
 
 		 363 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  24.23 
 
 		 363 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.68 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  23.89 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  27.02 
 
 		 301 aa  82.8  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  29.8 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  36.97 
 
 		 256 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  37.42 
 
 		 256 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  31.96 
 
 		 302 aa  79.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  36.97 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  28.72 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  27.97 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  27.78 
 
 		 311 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  26.69 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  27.09 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  30.03 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  27.27 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  26.92 
 
 		 301 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  26.92 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  27.18 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  27.08 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  27.08 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  28.91 
 
 		 299 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.74 
 
 		 297 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  28.37 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3049  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  29.29 
 
 		 604 aa  70.5  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.749851  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.76 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1143  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.09 
 
 		 601 aa  70.1  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3061  amidophosphoribosyltransferase  28.92 
 
 		 629 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  28 
 
 		 302 aa  69.3  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  25.96 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  26.67 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  25.96 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  29.65 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  26.74 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2343  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.74 
 
 		 614 aa  67  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0472138  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  34.53 
 
 		 257 aa  66.6  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  37.04 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  27.21 
 
 		 301 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  31.71 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>