More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1816 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  100 
 
 
251 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  68.18 
 
 
281 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  69.32 
 
 
251 aa  349  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  55.51 
 
 
246 aa  263  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  52.87 
 
 
248 aa  259  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  51.03 
 
 
245 aa  258  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  52.28 
 
 
242 aa  258  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  257  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  51.43 
 
 
250 aa  255  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  52.05 
 
 
252 aa  255  5e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  51.44 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  51.44 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  50.41 
 
 
249 aa  250  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  51.04 
 
 
245 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  48.61 
 
 
256 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  47.04 
 
 
256 aa  232  5e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  47.62 
 
 
263 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  45.49 
 
 
246 aa  231  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  47.41 
 
 
256 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  46.15 
 
 
245 aa  229  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  45.42 
 
 
261 aa  226  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  45.75 
 
 
247 aa  224  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  45.49 
 
 
247 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  46.69 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  45.64 
 
 
256 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  45.56 
 
 
248 aa  208  7e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  45.64 
 
 
256 aa  208  8e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  46.06 
 
 
256 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  46.4 
 
 
264 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  42.4 
 
 
670 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  40 
 
 
659 aa  126  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  40.44 
 
 
646 aa  125  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  41.18 
 
 
568 aa  106  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  37.95 
 
 
568 aa  105  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.66 
 
 
572 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  39.26 
 
 
553 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.23 
 
 
1521 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.14 
 
 
794 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.81 
 
 
777 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.17 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.95 
 
 
1550 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.5 
 
 
793 aa  71.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  30.77 
 
 
771 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.62 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  33.12 
 
 
1465 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.12 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  35.44 
 
 
1524 aa  69.7  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  26.9 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0326  glutamate synthase (ferredoxin)  30.73 
 
 
1533 aa  68.9  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.144966 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1078  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.6 
 
 
1513 aa  68.9  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.706498  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.77 
 
 
1530 aa  68.6  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.94 
 
 
1529 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.94 
 
 
1475 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  30.06 
 
 
1535 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.92 
 
 
1554 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.33 
 
 
1527 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.96 
 
 
1520 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.46 
 
 
1519 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.43 
 
 
1518 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.43 
 
 
1518 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.43 
 
 
1518 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.94 
 
 
1531 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0526  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.57 
 
 
1548 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.801021  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.06 
 
 
1474 aa  65.5  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  29.15 
 
 
1508 aa  65.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.78 
 
 
776 aa  65.1  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  28.86 
 
 
1514 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  29.91 
 
 
1516 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  27.66 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  29.91 
 
 
1516 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.81 
 
 
777 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.54 
 
 
1525 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.89 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  25.94 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  26.07 
 
 
228 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3213  Glutamate synthase (ferredoxin)  28 
 
 
1542 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.43 
 
 
1536 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0567  glutamate synthase  28.57 
 
 
1523 aa  63.9  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2866  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.25 
 
 
1519 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166773  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1686  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.7 
 
 
1537 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  26.86 
 
 
228 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.8 
 
 
1524 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  27.62 
 
 
1518 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  27.14 
 
 
1515 aa  62.4  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  25.7 
 
 
225 aa  62.4  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0118  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.7 
 
 
1537 aa  62  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.750611  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  29.94 
 
 
1571 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  26.69 
 
 
771 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.75 
 
 
228 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.72 
 
 
381 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.41 
 
 
1554 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.05 
 
 
1551 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  29.67 
 
 
1530 aa  59.3  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.99 
 
 
1502 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23581  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.3 
 
 
1527 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.242858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.43 
 
 
777 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  29.57 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  26.11 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  27.5 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  23.46 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>