87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2500 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  72.32 
 
 		 236 aa  337  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  63.39 
 
 		 229 aa  289  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  61.67 
 
 		 232 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  57.4 
 
 		 224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  56.5 
 
 		 227 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  56.05 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  56.95 
 
 		 224 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  55.91 
 
 		 225 aa  244  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  55.36 
 
 		 227 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  54.91 
 
 		 227 aa  242  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  53.95 
 
 		 228 aa  241  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  54.22 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  53.33 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  54.19 
 
 		 229 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  53.78 
 
 		 230 aa  237  9e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  53.51 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  52.21 
 
 		 228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  53.78 
 
 		 228 aa  234  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  53.78 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  53.54 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  52.65 
 
 		 229 aa  232  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  53.36 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  52.89 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  52.21 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  52.21 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  52.44 
 
 		 238 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  52.44 
 
 		 238 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  53.33 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  50 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  51.56 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2633  glutamate synthase alpha subunit domain protein  49.34 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.65 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  32.54 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.12 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.04 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  29.44 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  27.85 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  26.41 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  26.7 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  26.7 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  25.97 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.11 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  25.23 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  31.91 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  33.33 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  28.16 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.24 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  28.16 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  25.52 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  26.62 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  24.42 
 
 		 670 aa  53.1  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  32.41 
 
 		 425 aa  52.8  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.24 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.01 
 
 		 249 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.82 
 
 		 286 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.64 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.19 
 
 		 646 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.75 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  26.46 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  37.78 
 
 		 270 aa  48.9  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  24.77 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  22.09 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  33.33 
 
 		 424 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  23.2 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.79 
 
 		 301 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.46 
 
 		 266 aa  45.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  28.95 
 
 		 415 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  28.79 
 
 		 415 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.9 
 
 		 272 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.47 
 
 		 777 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.03 
 
 		 777 aa  45.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  23.33 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.67 
 
 		 415 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  23.44 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  29.7 
 
 		 312 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  26.21 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.09 
 
 		 794 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.22 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.41 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  24.08 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.71 
 
 		 265 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  24.14 
 
 		 320 aa  42.4  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  27.67 
 
 		 247 aa  42  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  25.81 
 
 		 332 aa  41.6  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  32.65 
 
 		 257 aa  41.6  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>