107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2233 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  100 
 
 
304 aa  610  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  71.64 
 
 
268 aa  403  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  65.04 
 
 
266 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  61.26 
 
 
307 aa  353  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  61.28 
 
 
266 aa  350  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  59.62 
 
 
266 aa  341  7e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  57.58 
 
 
332 aa  323  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  57.74 
 
 
275 aa  317  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  56.77 
 
 
266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  44.27 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  41.95 
 
 
301 aa  192  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  41.61 
 
 
269 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  40 
 
 
272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.87 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  40.43 
 
 
272 aa  179  7e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  39.66 
 
 
289 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  35.97 
 
 
425 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  40.96 
 
 
257 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  37.41 
 
 
424 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  41.55 
 
 
415 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  40.54 
 
 
415 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.54 
 
 
415 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  35.45 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.98 
 
 
274 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  33.08 
 
 
255 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  33.64 
 
 
270 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  33.33 
 
 
256 aa  116  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.94 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.98 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  29.15 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.81 
 
 
269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.51 
 
 
276 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.22 
 
 
268 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  26.87 
 
 
281 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.02 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  29.73 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.14 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.46 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.82 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.72 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.52 
 
 
265 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  36.51 
 
 
568 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.05 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.54 
 
 
228 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  38.79 
 
 
568 aa  57.4  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  31.75 
 
 
228 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  31.75 
 
 
228 aa  56.6  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  31.75 
 
 
228 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.75 
 
 
236 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.47 
 
 
228 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.75 
 
 
224 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  30.54 
 
 
245 aa  53.9  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  29.46 
 
 
225 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  30.54 
 
 
245 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.19 
 
 
238 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.19 
 
 
238 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.56 
 
 
242 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0525  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C-like  27.21 
 
 
295 aa  52.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.618523  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.51 
 
 
238 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  35.77 
 
 
152 aa  52.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.08 
 
 
247 aa  52.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.23 
 
 
230 aa  52.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  32.79 
 
 
228 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  30.77 
 
 
553 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  35.85 
 
 
312 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  29.46 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  29.46 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  29.46 
 
 
227 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  30.95 
 
 
229 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  28.93 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  34.88 
 
 
670 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  29.46 
 
 
232 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.3 
 
 
659 aa  50.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  30.23 
 
 
224 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.75 
 
 
225 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.44 
 
 
247 aa  49.7  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  28.68 
 
 
228 aa  49.3  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1762  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  40.58 
 
 
105 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.65 
 
 
572 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  31.72 
 
 
227 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.87 
 
 
229 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  27.91 
 
 
227 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.71 
 
 
245 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  28.39 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  29.37 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.37 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  29.17 
 
 
1465 aa  47.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  36.67 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  37.1 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  30.71 
 
 
247 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  28.24 
 
 
1473 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  34.92 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  28.33 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.56 
 
 
248 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  30.53 
 
 
256 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.5 
 
 
252 aa  45.8  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.47 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.65 
 
 
646 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  28.89 
 
 
261 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>