82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1793 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 		 267 aa  488  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  44.03 
 
 		 269 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  39.41 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  38.29 
 
 		 269 aa  158  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  42.98 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  40 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  36.3 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  41.09 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  44.27 
 
 		 264 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  41.6 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  44.54 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.26 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.91 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  41.22 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  44.27 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.08 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.22 
 
 		 281 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.8 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  35.92 
 
 		 415 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  29.41 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  32.14 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.73 
 
 		 304 aa  96.7  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.2 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.88 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  35.44 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  25.6 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.95 
 
 		 415 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.18 
 
 		 307 aa  92.4  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  27.03 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  32.51 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  28.22 
 
 		 425 aa  91.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  30.63 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  28.57 
 
 		 332 aa  90.1  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  25.6 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.02 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.83 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  28.1 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  32.31 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  32.04 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.23 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  32.17 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  34.9 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.8 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  33.82 
 
 		 568 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  37.17 
 
 		 568 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  32.28 
 
 		 1479 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  31.65 
 
 		 553 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.78 
 
 		 1474 aa  48.9  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  32.64 
 
 		 1486 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  25.15 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  32.6 
 
 		 1486 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.09 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  24 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.48 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  32.81 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.96 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  31.61 
 
 		 1486 aa  45.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.84 
 
 		 646 aa  45.8  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.38 
 
 		 776 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.7 
 
 		 572 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  37.82 
 
 		 1475 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  32.04 
 
 		 1486 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  29.84 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.82 
 
 		 1475 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  33.92 
 
 		 1482 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  32.94 
 
 		 1482 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  31.3 
 
 		 1465 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  38.21 
 
 		 1482 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  32.62 
 
 		 227 aa  43.9  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3656  glutamate synthase subunit alpha  32.12 
 
 		 1516 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.166032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  30.05 
 
 		 1482 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  36.75 
 
 		 1486 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  25.64 
 
 		 312 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  31.95 
 
 		 1482 aa  43.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.13 
 
 		 1469 aa  42.7  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.45 
 
 		 659 aa  42.7  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  34.59 
 
 		 1482 aa  42  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  37.82 
 
 		 1535 aa  42  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  37.82 
 
 		 1485 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  37.82 
 
 		 1485 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.98 
 
 		 252 aa  42  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  29.27 
 
 		 232 aa  42  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>