125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0875 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  100 
 
 		 266 aa  542  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  60.38 
 
 		 268 aa  350  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  61.28 
 
 		 304 aa  348  4e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  59.62 
 
 		 275 aa  335  5e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  57.74 
 
 		 266 aa  331  8e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  56.23 
 
 		 266 aa  323  2e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  58.56 
 
 		 332 aa  321  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  54.89 
 
 		 266 aa  316  3e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  55.64 
 
 		 307 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  43.23 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  39.85 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.61 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  40.61 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  41.37 
 
 		 301 aa  185  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  41.04 
 
 		 425 aa  185  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  37.55 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  38.71 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  37.72 
 
 		 415 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  38.16 
 
 		 415 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.16 
 
 		 415 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  35.63 
 
 		 424 aa  148  7e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  36.55 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  31.11 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  30.92 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  27.65 
 
 		 270 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.08 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.42 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.38 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.85 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.38 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  26.32 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.12 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.15 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.9 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.4 
 
 		 291 aa  95.5  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.42 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  27.03 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.27 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.18 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  25.11 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  34.68 
 
 		 553 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  38.46 
 
 		 572 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.03 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  34.13 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.87 
 
 		 1530 aa  56.6  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  29.66 
 
 		 568 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  24.66 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  33.94 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  33.12 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  33.94 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  33.12 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  30.77 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  32.74 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  29.11 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  35.16 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  30 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.65 
 
 		 1533 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.23 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.13 
 
 		 247 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  36.14 
 
 		 245 aa  49.3  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  28.86 
 
 		 1487 aa  49.3  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  31.25 
 
 		 670 aa  48.9  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  36.17 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  34.83 
 
 		 227 aa  48.9  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  27.61 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.91 
 
 		 659 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  28.19 
 
 		 1487 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0466  glutamate synthase (ferredoxin)  26.06 
 
 		 1546 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  34.04 
 
 		 152 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.15 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  27.59 
 
 		 1487 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  31.06 
 
 		 1482 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.28 
 
 		 281 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  25.49 
 
 		 1465 aa  46.2  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  28.49 
 
 		 1554 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  29.82 
 
 		 1486 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  29.92 
 
 		 1481 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  28 
 
 		 1482 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  27.13 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  36.25 
 
 		 1482 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  32.63 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  27.18 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.87 
 
 		 1524 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  29.1 
 
 		 1483 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5698  glutamate synthase (ferredoxin)  27.21 
 
 		 1514 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471666 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  28.02 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.49 
 
 		 1521 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  29.55 
 
 		 1482 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.63 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.95 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  25.21 
 
 		 1473 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0107  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.23 
 
 		 1535 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  28.24 
 
 		 1475 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.12 
 
 		 646 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  27.91 
 
 		 1546 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  25 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.24 
 
 		 1475 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1604  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.87 
 
 		 1468 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>