118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0283 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  100 
 
 
269 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  62.45 
 
 
301 aa  341  7e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  49.82 
 
 
415 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  50.55 
 
 
415 aa  255  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  49.45 
 
 
415 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  48.21 
 
 
425 aa  249  4e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  47.23 
 
 
424 aa  246  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  41.61 
 
 
304 aa  202  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  43.15 
 
 
266 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  42.75 
 
 
268 aa  193  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.93 
 
 
307 aa  186  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  41.94 
 
 
275 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  39.27 
 
 
272 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  40.87 
 
 
294 aa  176  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  39.27 
 
 
272 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  37.69 
 
 
266 aa  175  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.27 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  36.73 
 
 
289 aa  169  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  38.71 
 
 
266 aa  169  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  40.97 
 
 
266 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  40.69 
 
 
332 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  36.43 
 
 
254 aa  158  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  36.26 
 
 
257 aa  156  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  37.6 
 
 
255 aa  141  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  32.71 
 
 
270 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.9 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.23 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  34.21 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.38 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.3 
 
 
269 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  27.88 
 
 
272 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28 
 
 
281 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.59 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.98 
 
 
276 aa  89  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.16 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.21 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  30.74 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1762  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  56.16 
 
 
105 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.11 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.21 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.18 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.16 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  24.88 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  35.62 
 
 
568 aa  65.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  30.15 
 
 
229 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  27.72 
 
 
228 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.77 
 
 
228 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.33 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.76 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.71 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.71 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  26.56 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  30.53 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  25.76 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.76 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.99 
 
 
242 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  29.01 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  33.09 
 
 
1473 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.24 
 
 
228 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1761  molybdenum formylmethanofuran dehydrogenase subunit  57.69 
 
 
84 aa  52.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.55 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  22.7 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.8 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.19 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  26.72 
 
 
225 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.81 
 
 
1527 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  26.32 
 
 
228 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  34.53 
 
 
553 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.38 
 
 
224 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  27.21 
 
 
229 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.84 
 
 
1527 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  25.19 
 
 
235 aa  48.9  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  32.06 
 
 
1484 aa  48.9  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  34.58 
 
 
1524 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  32.59 
 
 
152 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  24.81 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.98 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  30.98 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  30.98 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  29.63 
 
 
568 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  37.36 
 
 
572 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.58 
 
 
1521 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.03 
 
 
225 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.66 
 
 
1519 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.57 
 
 
1530 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  25.73 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  24.12 
 
 
227 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  25.64 
 
 
312 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  23.26 
 
 
229 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  24.75 
 
 
320 aa  46.2  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  32.26 
 
 
1535 aa  45.4  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  28.03 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  28.03 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3392  glutamate synthase (ferredoxin)  26.89 
 
 
1573 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140054  normal  0.116852 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.45 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.3 
 
 
1533 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.57 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3166  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.15 
 
 
1516 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.563815  normal  0.707717 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2166  glutamate synthase subunit alpha  32.28 
 
 
1489 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>