129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5773 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  100 
 
 
265 aa  485  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  85.66 
 
 
265 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  64.75 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  67.3 
 
 
265 aa  289  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  66.67 
 
 
265 aa  278  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  66.67 
 
 
265 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  47.73 
 
 
268 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  46.56 
 
 
269 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  42.76 
 
 
286 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  46.1 
 
 
276 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  43.66 
 
 
274 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  37.88 
 
 
272 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  36.78 
 
 
269 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  40.38 
 
 
270 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  40.79 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.15 
 
 
281 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  42.21 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.45 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  28.31 
 
 
425 aa  88.6  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  34.32 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  32.7 
 
 
415 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  30.92 
 
 
275 aa  85.5  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  26.18 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  30.31 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.18 
 
 
415 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  32.34 
 
 
268 aa  82  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.26 
 
 
301 aa  82  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  32.84 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  31.22 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  32.23 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  26.61 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  30.16 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  23.81 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  31.74 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  27.42 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.14 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.18 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.18 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  30.59 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  25.88 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.59 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.02 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.01 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  35.14 
 
 
1479 aa  53.9  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.19 
 
 
1474 aa  53.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.4 
 
 
572 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  35.24 
 
 
312 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  37.11 
 
 
250 aa  52.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  35.42 
 
 
264 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56605  predicted protein  34.13 
 
 
1697 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0809416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.63 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.05 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51965  predicted protein  34.43 
 
 
1562 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.738666  normal  0.0653658 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  35.38 
 
 
568 aa  50.4  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  31.51 
 
 
1465 aa  50.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  34.29 
 
 
313 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  27.33 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  34.51 
 
 
553 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  32.38 
 
 
312 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  33.12 
 
 
229 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.19 
 
 
1475 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.12 
 
 
1468 aa  49.7  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  34.19 
 
 
1475 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.12 
 
 
229 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.12 
 
 
229 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  37.82 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  37.82 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0326  glutamate synthase (ferredoxin)  33.58 
 
 
1533 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.144966 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  32.74 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.64 
 
 
1502 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  32.11 
 
 
320 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  36.56 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  31.08 
 
 
1499 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  31.08 
 
 
1499 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  31.93 
 
 
1535 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.79 
 
 
251 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  33.07 
 
 
1536 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0019  glutamate synthase (NADPH) large subunit  27.01 
 
 
1524 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  35.25 
 
 
1488 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.99 
 
 
240 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  34.38 
 
 
248 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.56 
 
 
1529 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.44 
 
 
381 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.21 
 
 
249 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.56 
 
 
1475 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.39 
 
 
224 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  28.98 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  31.4 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  31.4 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  28.98 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34.74 
 
 
281 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.4 
 
 
256 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  36.44 
 
 
224 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  35.82 
 
 
152 aa  45.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  32.58 
 
 
568 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  37.97 
 
 
232 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  39.08 
 
 
228 aa  45.4  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.25 
 
 
1554 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  31.13 
 
 
1473 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0302  glutamate synthase (NADPH) large subunit  31.47 
 
 
1509 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.466931 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>