103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1596 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  100 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  96.09 
 
 
263 aa  502  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  96.09 
 
 
256 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  82.03 
 
 
256 aa  442  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  70.31 
 
 
261 aa  372  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  53.36 
 
 
247 aa  268  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  48.82 
 
 
247 aa  266  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  52.38 
 
 
246 aa  263  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  51.79 
 
 
245 aa  260  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  48.59 
 
 
245 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  48.59 
 
 
245 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  48.02 
 
 
248 aa  244  6.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  48.61 
 
 
251 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  48.58 
 
 
240 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  45.78 
 
 
246 aa  230  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  44.84 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  48 
 
 
252 aa  217  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  44.71 
 
 
249 aa  214  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  45.16 
 
 
251 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  43.36 
 
 
248 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  44.94 
 
 
242 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  46.31 
 
 
256 aa  205  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  45.42 
 
 
256 aa  205  7e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  43.25 
 
 
264 aa  204  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  45.42 
 
 
256 aa  202  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  45.2 
 
 
248 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  43.08 
 
 
281 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  41.77 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  40.08 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  33.22 
 
 
670 aa  150  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  39.9 
 
 
659 aa  122  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.9 
 
 
646 aa  122  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  30.83 
 
 
568 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  30.86 
 
 
568 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  31.02 
 
 
553 aa  101  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.08 
 
 
572 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  31.06 
 
 
771 aa  78.6  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  28.74 
 
 
771 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.23 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.41 
 
 
635 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.76 
 
 
794 aa  69.7  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.03 
 
 
777 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.23 
 
 
793 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.5 
 
 
777 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.49 
 
 
777 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.53 
 
 
776 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  34.72 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  36.11 
 
 
424 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  28.81 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  27.07 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  26.27 
 
 
229 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  34.17 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  24 
 
 
1524 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  26.87 
 
 
227 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.76 
 
 
228 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  26.95 
 
 
227 aa  52  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.85 
 
 
269 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  30.11 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2633  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.91 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  25.9 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.29 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  35.48 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.94 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  25.99 
 
 
227 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  33.03 
 
 
272 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  26.99 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  33.72 
 
 
320 aa  49.3  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  30.4 
 
 
425 aa  49.3  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.06 
 
 
224 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  26.24 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  31.91 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.19 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5698  glutamate synthase (ferredoxin)  24.58 
 
 
1514 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.471666 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  34.26 
 
 
415 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  33.94 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.08 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  23.48 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.77 
 
 
1525 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.12 
 
 
1530 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  33.64 
 
 
312 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.23 
 
 
1469 aa  46.6  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  23.37 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  38.46 
 
 
313 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  23.15 
 
 
230 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.4 
 
 
265 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  36.92 
 
 
312 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  25.93 
 
 
228 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  25.9 
 
 
235 aa  45.4  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3213  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.3 
 
 
1542 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  24.54 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.24 
 
 
1474 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.19 
 
 
301 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  32.98 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.15 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  25 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  32 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.91 
 
 
304 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  32.41 
 
 
415 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>