156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2464 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  57.59 
 
 		 286 aa  315  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  48.01 
 
 		 274 aa  245  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  46.67 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  44.09 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  41.58 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  42.86 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  41.43 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  37.91 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.73 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.55 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.27 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  40 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.71 
 
 		 265 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  41.52 
 
 		 265 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.55 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.91 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  26.55 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.41 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.65 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  26.99 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  29.61 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  31.29 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  29.8 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.75 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  30.15 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.72 
 
 		 266 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  29.06 
 
 		 415 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  27.88 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.63 
 
 		 415 aa  96.3  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  25.76 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  28.21 
 
 		 415 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  24.7 
 
 		 424 aa  94  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  26.58 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  26.96 
 
 		 254 aa  89.4  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  27.83 
 
 		 275 aa  86.3  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  25.55 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.17 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.52 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  28.14 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.27 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  25 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  34.38 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  29.05 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  29.73 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.96 
 
 		 1475 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  28.96 
 
 		 1475 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  34.82 
 
 		 568 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  34.82 
 
 		 568 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  41.18 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  30.46 
 
 		 553 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  37.89 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  38.54 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  29 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  28.49 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  34.15 
 
 		 1487 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  33.06 
 
 		 1488 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.14 
 
 		 1468 aa  50.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.46 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.32 
 
 		 572 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.8 
 
 		 252 aa  49.3  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  37.04 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  33.61 
 
 		 1481 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  28.06 
 
 		 1562 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  34.58 
 
 		 1473 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0525  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C-like  39.68 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.618523  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.23 
 
 		 1474 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4949  glutamate synthase subunit alpha  33.61 
 
 		 1481 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  27.54 
 
 		 1536 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5126  glutamate synthase subunit alpha  32.77 
 
 		 1481 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.979784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.05 
 
 		 1519 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5773  glutamate synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 1481 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  31.54 
 
 		 1481 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66570  glutamate synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 1481 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0683  glutamate synthase (ferredoxin)  31.86 
 
 		 1580 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.146525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  33.06 
 
 		 1484 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  32.26 
 
 		 2126 aa  47.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0612  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.86 
 
 		 1539 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4114  glutamate synthase subunit alpha  31.71 
 
 		 1461 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000785816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  36.28 
 
 		 230 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0390  glutamate synthase subunit alpha  32.77 
 
 		 1481 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  34.45 
 
 		 1482 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  23.53 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.43 
 
 		 1554 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03319  glutamate synthase subunit alpha  29.93 
 
 		 1462 aa  46.2  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.645921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0466  glutamate synthase (ferredoxin)  26.62 
 
 		 1546 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  23.37 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2131  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.84 
 
 		 1502 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.150906 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  31.54 
 
 		 1507 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  28.93 
 
 		 225 aa  45.8  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23581  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.33 
 
 		 1527 aa  45.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.242858 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  32.35 
 
 		 263 aa  45.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1957  glutamate synthase subunit alpha  30.4 
 
 		 1493 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  29.13 
 
 		 1571 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  32.39 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.04 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  32.77 
 
 		 1460 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.12 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  32.26 
 
 		 1487 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>