82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0201 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  100 
 
 		 307 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  66.04 
 
 		 275 aa  359  4e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  64.29 
 
 		 266 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  60.28 
 
 		 304 aa  352  7e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  63.3 
 
 		 266 aa  344  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  55.64 
 
 		 266 aa  310  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  55.76 
 
 		 268 aa  301  1e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  54.1 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  51.13 
 
 		 266 aa  276  3e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  48.44 
 
 		 294 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  38.58 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  41 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  40.18 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  39.03 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.45 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  39.93 
 
 		 269 aa  170  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  36.78 
 
 		 425 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  44.44 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.45 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  42.34 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  36.24 
 
 		 424 aa  153  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  37.97 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  36.76 
 
 		 254 aa  139  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  34.59 
 
 		 255 aa  126  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  33.64 
 
 		 270 aa  122  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  34.12 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  35.11 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.47 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  34.6 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.18 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.03 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.42 
 
 		 281 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.83 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.75 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.67 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  32.69 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.18 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.47 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.9 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.88 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.46 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.61 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.61 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  27.03 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  27.16 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.16 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  26.54 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  37.07 
 
 		 568 aa  53.9  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.71 
 
 		 228 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  25.57 
 
 		 228 aa  52.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  32.33 
 
 		 568 aa  52.4  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.34 
 
 		 229 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  30.34 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.34 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  31.13 
 
 		 553 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1762  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  43.48 
 
 		 105 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  43.28 
 
 		 236 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  29.45 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  29.09 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.25 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  36.56 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  36.56 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.77 
 
 		 242 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  26.71 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  34.13 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  37.84 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  29.17 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  30.3 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34.34 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  30.3 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  26.82 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  24.28 
 
 		 227 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  26.35 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  31.06 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  36.26 
 
 		 227 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.77 
 
 		 230 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  26.98 
 
 		 1465 aa  43.5  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.78 
 
 		 572 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.97 
 
 		 1524 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0526  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.47 
 
 		 1548 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.801021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  30.22 
 
 		 251 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  28.57 
 
 		 228 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>