More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0830 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 		 568 aa  1132    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  60.78 
 
 		 553 aa  654    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  82.39 
 
 		 568 aa  965    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  57.27 
 
 		 572 aa  622  1e-177  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.12 
 
 		 646 aa  285  2.0000000000000002e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  36.79 
 
 		 670 aa  283  6.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34 
 
 		 659 aa  281  2e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  36.4 
 
 		 245 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  36.12 
 
 		 245 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  36.12 
 
 		 245 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  38.14 
 
 		 242 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  30 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  31.62 
 
 		 263 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.99 
 
 		 245 aa  113  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  30.83 
 
 		 256 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  33.18 
 
 		 374 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  27.4 
 
 		 365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.4 
 
 		 350 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  38.25 
 
 		 250 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  29.06 
 
 		 256 aa  111  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.57 
 
 		 363 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.83 
 
 		 256 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  27.97 
 
 		 364 aa  110  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  27.5 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  26.09 
 
 		 395 aa  108  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  26.57 
 
 		 350 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  33.19 
 
 		 355 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  37.56 
 
 		 281 aa  108  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  30.56 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  26.09 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.92 
 
 		 252 aa  107  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.22 
 
 		 373 aa  107  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  35.6 
 
 		 247 aa  106  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  26.33 
 
 		 261 aa  106  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  41.18 
 
 		 251 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  38.65 
 
 		 240 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  37.38 
 
 		 251 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  27.01 
 
 		 382 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.72 
 
 		 364 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  32.71 
 
 		 248 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  34.21 
 
 		 264 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  32.55 
 
 		 339 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  36.02 
 
 		 245 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  34.15 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  35.02 
 
 		 248 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  37.29 
 
 		 247 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  33.5 
 
 		 350 aa  99.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  35.98 
 
 		 246 aa  99.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  32.2 
 
 		 369 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.98 
 
 		 249 aa  97.8  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  25 
 
 		 364 aa  97.4  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  30.12 
 
 		 246 aa  95.9  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  25.34 
 
 		 363 aa  94.7  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  27.07 
 
 		 361 aa  94.7  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  33.33 
 
 		 359 aa  94.4  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  26.65 
 
 		 378 aa  93.6  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  25.19 
 
 		 376 aa  92  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.57 
 
 		 376 aa  91.3  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.71 
 
 		 248 aa  90.5  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.45 
 
 		 363 aa  90.1  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  36.02 
 
 		 256 aa  89  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  23.35 
 
 		 363 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  25.58 
 
 		 376 aa  89.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  23.08 
 
 		 363 aa  87.8  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  36.65 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  36.65 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  29.44 
 
 		 1475 aa  70.1  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.44 
 
 		 1475 aa  70.1  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  34.93 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.1 
 
 		 1530 aa  68.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  28.9 
 
 		 459 aa  67  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  37.96 
 
 		 272 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0992  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.43 
 
 		 602 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  36.22 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  36.79 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  35.92 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2343  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.78 
 
 		 614 aa  65.1  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0472138  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  40.16 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51965  predicted protein  29.57 
 
 		 1562 aa  64.7  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.738666  normal  0.0653658 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  39.34 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.61 
 
 		 1551 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.98 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.67 
 
 		 268 aa  63.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  35.25 
 
 		 1535 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  39.17 
 
 		 257 aa  63.5  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.21 
 
 		 1524 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03077  glutamate synthase, large subunit  34.72 
 
 		 1517 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.427677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0495  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.72 
 
 		 1517 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0488  glutamate synthase subunit alpha  34.72 
 
 		 1522 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.690727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  31.76 
 
 		 1487 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3405  glutamate synthase subunit alpha  34.72 
 
 		 1486 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  32.7 
 
 		 1473 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3508  glutamate synthase subunit alpha  34.72 
 
 		 1517 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.12 
 
 		 1474 aa  62.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.03 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4535  glutamate synthase subunit alpha  34.72 
 
 		 1517 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3558  glutamate synthase subunit alpha  34.72 
 
 		 1486 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03028  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1517 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.403109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3700  glutamate synthase subunit alpha  34.72 
 
 		 1486 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.83 
 
 		 1475 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>