More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0025 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 
365 aa  746    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  69.44 
 
 
364 aa  552  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  62.18 
 
 
355 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  59.44 
 
 
368 aa  471  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  57.26 
 
 
374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  58.64 
 
 
371 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  57.38 
 
 
372 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  56.5 
 
 
373 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  57.38 
 
 
395 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  59.78 
 
 
363 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  59.39 
 
 
339 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  56.45 
 
 
364 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  54.2 
 
 
369 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  53.33 
 
 
364 aa  418  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  53.98 
 
 
376 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  52.84 
 
 
376 aa  401  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  52.56 
 
 
376 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  51.98 
 
 
359 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  51.86 
 
 
350 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  51.98 
 
 
378 aa  391  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  48.99 
 
 
350 aa  382  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  50.68 
 
 
363 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  50.68 
 
 
363 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  50.42 
 
 
361 aa  369  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  48.41 
 
 
350 aa  368  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  49.04 
 
 
363 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  48.22 
 
 
363 aa  360  2e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  49.86 
 
 
349 aa  360  3e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  48.41 
 
 
382 aa  350  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  42.9 
 
 
350 aa  317  3e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32 
 
 
659 aa  168  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  33.06 
 
 
670 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.37 
 
 
646 aa  146  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  30.17 
 
 
568 aa  122  8e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  28.25 
 
 
568 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  27.81 
 
 
553 aa  103  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31 
 
 
572 aa  103  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  25.39 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.72 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3016  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.76 
 
 
1524 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  24.41 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  28.34 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  28.28 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  26.32 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  28.85 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  27.54 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  30.48 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  22.74 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  24.01 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.05 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  29.19 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2866  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.82 
 
 
1527 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  25.15 
 
 
306 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.52 
 
 
1519 aa  66.2  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  25.85 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  26.44 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  23.8 
 
 
1510 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  26.98 
 
 
298 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  24.41 
 
 
1510 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  25.53 
 
 
302 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  26.44 
 
 
298 aa  63.5  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1350  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.24 
 
 
1527 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000183365 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1346  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.53 
 
 
1520 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0502  glutamate synthase (ferredoxin)  26.61 
 
 
1533 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.154267  normal  0.477392 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  24.64 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0781  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.72 
 
 
1533 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251608  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  26.79 
 
 
308 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0628  glutamate synthase (NADH) large subunit  25.22 
 
 
1533 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0186  glutamate synthase, large subunit  27.78 
 
 
1533 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  25.49 
 
 
1507 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  24.15 
 
 
301 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2805  glutamate synthase (ferredoxin)  30.29 
 
 
1525 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  23.26 
 
 
1516 aa  60.1  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2161  glutamate synthase (ferredoxin)  25 
 
 
1519 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706434  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  24.6 
 
 
302 aa  59.7  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1937  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.45 
 
 
1533 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  26.57 
 
 
302 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.38 
 
 
298 aa  59.7  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  25.65 
 
 
456 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  23 
 
 
302 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0672  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.91 
 
 
1534 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4950  glutamate synthase (ferredoxin)  25.96 
 
 
1509 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544718  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  26.98 
 
 
298 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  21.39 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  24.3 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  21.21 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  24.58 
 
 
1574 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  24.21 
 
 
1510 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  26.98 
 
 
298 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  26.98 
 
 
298 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.87 
 
 
1499 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  25.26 
 
 
479 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  26.96 
 
 
1507 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1253  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.49 
 
 
1479 aa  57  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  23.81 
 
 
301 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.43 
 
 
1510 aa  56.6  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  26.29 
 
 
299 aa  56.6  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  23.56 
 
 
301 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.36 
 
 
1483 aa  56.2  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  24.61 
 
 
459 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>