More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1338 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 364 aa  756    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  77.47 
 
 		 364 aa  618  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  80.06 
 
 		 369 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  59.5 
 
 		 371 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  59.05 
 
 		 373 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  58.45 
 
 		 364 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  61.31 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  56.3 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  56.3 
 
 		 395 aa  426  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  54.7 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  56.45 
 
 		 365 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  56.78 
 
 		 376 aa  421  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  56.37 
 
 		 376 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  55.65 
 
 		 376 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  52.59 
 
 		 374 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  52.44 
 
 		 368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  52.63 
 
 		 378 aa  381  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  52.15 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  50.29 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.84 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  50.86 
 
 		 363 aa  359  4e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  47.97 
 
 		 350 aa  358  9e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  50.29 
 
 		 349 aa  355  6.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  47.12 
 
 		 363 aa  344  1e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  46.43 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  46.01 
 
 		 361 aa  341  2e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  46.3 
 
 		 363 aa  339  5e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  49.42 
 
 		 382 aa  339  5e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  45.05 
 
 		 363 aa  338  9e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  43.02 
 
 		 350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.11 
 
 		 659 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.53 
 
 		 646 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  30.71 
 
 		 670 aa  136  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  26.93 
 
 		 568 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  25 
 
 		 568 aa  96.3  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  28.05 
 
 		 553 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.34 
 
 		 572 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  28.51 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  27.83 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  27.36 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  28.7 
 
 		 368 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  26.78 
 
 		 301 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  27.08 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  27.91 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  25.69 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  24 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  26.32 
 
 		 299 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  26.73 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2763  glutamate synthase subunit alpha  29.81 
 
 		 1491 aa  66.6  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  24.41 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.18 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  23.58 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  25.92 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  26.55 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  23.6 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  28.43 
 
 		 1513 aa  62.8  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.99 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  23.87 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  25.31 
 
 		 1574 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  23.6 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  23.6 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.86 
 
 		 1499 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  28.57 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  23.4 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  28.63 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.81 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  25.36 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  28.05 
 
 		 1482 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2140  glutamate synthase (ferredoxin)  25.96 
 
 		 1510 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  24.42 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.44 
 
 		 1487 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  25.36 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1617  glutamate synthase (ferredoxin)  24.3 
 
 		 1553 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  25.57 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.32 
 
 		 1468 aa  60.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  25.65 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  26.7 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  24.88 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0341  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.69 
 
 		 1489 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  23.5 
 
 		 1509 aa  59.3  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.39 
 
 		 1575 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.34 
 
 		 1483 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.88 
 
 		 1510 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  22.62 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.08 
 
 		 1486 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  28.93 
 
 		 1498 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  26.51 
 
 		 1510 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  25.32 
 
 		 1516 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  25.96 
 
 		 1482 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1371  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.92 
 
 		 1578 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25743 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1350  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.67 
 
 		 1527 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000183365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  26.7 
 
 		 1481 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  25.71 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  29.17 
 
 		 1507 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  26.83 
 
 		 1482 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  27.27 
 
 		 1510 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  26.88 
 
 		 1510 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  25.64 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3734  glutamate synthase large subunit  25.33 
 
 		 1573 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  26.94 
 
 		 1507 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>