More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0558 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 
374 aa  773    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  61.56 
 
 
355 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  58.94 
 
 
364 aa  472  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  57.54 
 
 
368 aa  468  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  57.26 
 
 
365 aa  435  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  56.25 
 
 
359 aa  435  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  58.89 
 
 
363 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  53.54 
 
 
371 aa  421  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  53.82 
 
 
373 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  52.59 
 
 
364 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  51 
 
 
369 aa  411  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  53.54 
 
 
395 aa  413  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  53.54 
 
 
372 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  50 
 
 
364 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  49.05 
 
 
376 aa  396  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  54.05 
 
 
339 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  49.59 
 
 
376 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  50.43 
 
 
376 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  50.71 
 
 
378 aa  388  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  50.29 
 
 
350 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  48.85 
 
 
350 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  45.4 
 
 
350 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  46.43 
 
 
363 aa  350  3e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.25 
 
 
363 aa  349  4e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  47.11 
 
 
361 aa  348  8e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  47.13 
 
 
349 aa  347  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  45.87 
 
 
382 aa  346  5e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  45.88 
 
 
363 aa  340  2e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  44.23 
 
 
363 aa  330  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  41.21 
 
 
350 aa  298  9e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.09 
 
 
659 aa  166  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.11 
 
 
646 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  31.96 
 
 
670 aa  142  9e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  33.81 
 
 
568 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  31.82 
 
 
568 aa  106  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  30.2 
 
 
553 aa  100  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.33 
 
 
572 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  28.5 
 
 
302 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  30 
 
 
311 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  30 
 
 
311 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  30 
 
 
316 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  25.35 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  28.06 
 
 
308 aa  77  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.42 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.84 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  26.15 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.13 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  27.78 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  29.55 
 
 
1498 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  23.31 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  24.32 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  29.74 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  26.5 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  26.77 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  27.23 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  26.15 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  27.04 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  22.98 
 
 
1518 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  31.25 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  24.1 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  26.46 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  24.58 
 
 
1507 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  25 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  24.14 
 
 
1509 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  24.77 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  26.53 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  27.36 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  25.25 
 
 
298 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  25.25 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  25.25 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.21 
 
 
1468 aa  64.7  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  35.58 
 
 
299 aa  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  25.18 
 
 
1507 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  25 
 
 
301 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2387  glutamate synthase (NADPH)  27.48 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  25.97 
 
 
1510 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  27.69 
 
 
480 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  28.8 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  26.7 
 
 
459 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  24.3 
 
 
479 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  23.08 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.38 
 
 
610 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  25.12 
 
 
1510 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  29.84 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  26.2 
 
 
302 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25 
 
 
298 aa  60.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  26.29 
 
 
459 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1988  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.29 
 
 
1497 aa  59.7  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0008  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.52 
 
 
607 aa  59.3  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.382171 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  23.06 
 
 
1513 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  25.65 
 
 
459 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  27.18 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.93 
 
 
1510 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  32.35 
 
 
591 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5123  glutamate synthase, large subunit  24.9 
 
 
1481 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2805  glutamate synthase (ferredoxin)  30.08 
 
 
1525 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  23 
 
 
296 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.33 
 
 
610 aa  58.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  29.17 
 
 
1487 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0390  glutamate synthase subunit alpha  25.74 
 
 
1481 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>