More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2026 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 359 aa  736    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  56.55 
 
 		 364 aa  441  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  58.64 
 
 		 368 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  58.4 
 
 		 355 aa  438  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  56.25 
 
 		 374 aa  435  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  56.02 
 
 		 373 aa  421  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  55.9 
 
 		 395 aa  424  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  55.9 
 
 		 372 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  56.3 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  52.66 
 
 		 376 aa  401  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  57.57 
 
 		 339 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  52.72 
 
 		 364 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  53.85 
 
 		 376 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  54.14 
 
 		 376 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  53.09 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  51.98 
 
 		 365 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  53.95 
 
 		 378 aa  391  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  52.17 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  49.86 
 
 		 350 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  52.15 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  48.27 
 
 		 350 aa  352  4e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  49.28 
 
 		 382 aa  352  5e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  46.11 
 
 		 350 aa  345  7e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  48.13 
 
 		 349 aa  342  5e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  45.75 
 
 		 361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  47.41 
 
 		 363 aa  334  1e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  45.5 
 
 		 363 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  44.96 
 
 		 363 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  45.23 
 
 		 363 aa  332  5e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  44.67 
 
 		 350 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  30.62 
 
 		 670 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.16 
 
 		 646 aa  143  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.13 
 
 		 659 aa  142  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  28.83 
 
 		 553 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  28.77 
 
 		 568 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  33.33 
 
 		 568 aa  87.8  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  28.05 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  25.44 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.32 
 
 		 572 aa  76.6  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  25.99 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  29.23 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.44 
 
 		 1510 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  28.72 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  28.06 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  28.06 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  27.32 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  25.94 
 
 		 1507 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  27.32 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  27.32 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.15 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  25 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  25.78 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  25 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  26.67 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  26.15 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.25 
 
 		 1518 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  28.45 
 
 		 1473 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  25.24 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  25.18 
 
 		 1513 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  26.5 
 
 		 1510 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3198  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.26 
 
 		 1518 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  27.55 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  27.04 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  25.69 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  28.78 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.64 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.66 
 
 		 1579 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.456903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2395  glutamate synthase (ferredoxin)  28.51 
 
 		 1586 aa  63.2  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  23.74 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  27.37 
 
 		 1510 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3135  Glutamate synthase (ferredoxin)  28 
 
 		 1527 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815016  normal  0.26832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  25.51 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  35.35 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.6 
 
 		 297 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.21 
 
 		 1511 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0741  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.47 
 
 		 1577 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.704994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  27.87 
 
 		 1583 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  27.87 
 
 		 1583 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.49 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  26.44 
 
 		 1487 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0912  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.57 
 
 		 1567 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00362249 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  25.89 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2529  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.62 
 
 		 1536 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.455706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  26.47 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  27.11 
 
 		 1498 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  26.32 
 
 		 1507 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  24.12 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  24.12 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  26.94 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  24.64 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  25.59 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0760  amidophosphoribosyltransferase  23.5 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  24.29 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.5 
 
 		 1499 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  24.88 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  28.34 
 
 		 1583 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1988  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.89 
 
 		 1497 aa  60.8  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  27.23 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0709  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.05 
 
 		 1577 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.849934  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  24.49 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>