More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0213 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 378 aa  784    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  56.6 
 
 		 376 aa  438  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  56.6 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  56.37 
 
 		 376 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  52.66 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  50.14 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  52.54 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  50.14 
 
 		 372 aa  391  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  50.68 
 
 		 373 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  53.95 
 
 		 359 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  50.83 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  50.71 
 
 		 374 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  49.33 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  51.69 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  52.63 
 
 		 364 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.48 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  53.39 
 
 		 339 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  48.6 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.31 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.85 
 
 		 350 aa  347  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  44.7 
 
 		 350 aa  332  9e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  46.7 
 
 		 349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  46.89 
 
 		 382 aa  325  6e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  41.92 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  42.12 
 
 		 363 aa  318  7e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  44.13 
 
 		 350 aa  318  7e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  41.3 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  41.03 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  40.76 
 
 		 363 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  39.54 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.62 
 
 		 646 aa  137  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.45 
 
 		 659 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  30.67 
 
 		 670 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  28.47 
 
 		 553 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.02 
 
 		 572 aa  89.7  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  26.52 
 
 		 568 aa  87.4  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  24.91 
 
 		 568 aa  83.2  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  27.91 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  25.3 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  27.4 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  24.73 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  28.71 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  24.72 
 
 		 1513 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  23.33 
 
 		 1507 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  25.84 
 
 		 1579 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.456903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5558  glutamate synthase (ferredoxin)  26.23 
 
 		 1576 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  0.943679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  22.27 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1957  glutamate synthase subunit alpha  23.39 
 
 		 1493 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2626  glutamate synthase (ferredoxin)  27.08 
 
 		 1585 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.77642  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  23.39 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1152  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.14 
 
 		 1584 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.49 
 
 		 1518 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3396  glutamate synthase (ferredoxin)  23.76 
 
 		 1588 aa  63.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  28.89 
 
 		 1498 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  24.28 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  23.71 
 
 		 1486 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45210  glutamate synthase subunit alpha  23.57 
 
 		 1480 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  24.66 
 
 		 1510 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0411  glutamate synthase subunit alpha  22.83 
 
 		 1481 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  23.96 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  23.41 
 
 		 1481 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  24.15 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2387  glutamate synthase (NADPH)  24.24 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0709  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.62 
 
 		 1577 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.849934  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0741  glutamate synthase (NADH) large subunit  25.62 
 
 		 1577 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.704994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  24.1 
 
 		 1510 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  36 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0791  glutamate synthase (NADH) large subunit  25.23 
 
 		 1580 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.116614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  20.79 
 
 		 1468 aa  59.3  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5123  glutamate synthase, large subunit  22.42 
 
 		 1481 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  22.35 
 
 		 1485 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4531  glutamate synthase ferredoxin subunit  26.5 
 
 		 1579 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688027  normal  0.696569 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  24.32 
 
 		 1516 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2933  glutamate synthase (ferredoxin)  24.13 
 
 		 1577 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  22.07 
 
 		 1505 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  22.35 
 
 		 1485 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  23.89 
 
 		 1530 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  23.04 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  24.53 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  25 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  22.35 
 
 		 1535 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.54 
 
 		 1511 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0683  glutamate synthase (ferredoxin)  25.53 
 
 		 1580 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.146525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  24.27 
 
 		 1481 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5126  glutamate synthase subunit alpha  23.04 
 
 		 1481 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.979784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  24.32 
 
 		 1516 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  22.81 
 
 		 1519 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.55 
 
 		 1474 aa  57.8  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0761  glutamate synthase ferredoxin subunit  26.03 
 
 		 1573 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220538  normal  0.186889 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.93 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.23 
 
 		 1499 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  23.04 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.5 
 
 		 1554 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2763  glutamate synthase subunit alpha  21.01 
 
 		 1491 aa  57  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1008  glutamate synthase (NADH) large subunit  24.77 
 
 		 1566 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  34.62 
 
 		 316 aa  57  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  23.5 
 
 		 459 aa  57  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  23.46 
 
 		 1507 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5773  glutamate synthase subunit alpha  22.57 
 
 		 1481 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66570  glutamate synthase subunit alpha  22.57 
 
 		 1481 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>