More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2710 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 		 350 aa  731    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  70.49 
 
 		 350 aa  547  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  69.71 
 
 		 350 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  69.71 
 
 		 382 aa  525  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  67.43 
 
 		 349 aa  520  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  61.49 
 
 		 350 aa  476  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  50.27 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  51.1 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  51.1 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  50.55 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.55 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  49.73 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  48.7 
 
 		 395 aa  378  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  48.7 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  48.99 
 
 		 365 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.42 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.55 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  47.97 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  48.1 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  45.4 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.17 
 
 		 373 aa  362  8e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  47.97 
 
 		 364 aa  358  8e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  45.74 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  45.24 
 
 		 376 aa  351  8.999999999999999e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  45.82 
 
 		 376 aa  349  4e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  48.81 
 
 		 339 aa  345  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  46.11 
 
 		 359 aa  345  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  44.38 
 
 		 376 aa  344  1e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  44.7 
 
 		 378 aa  332  8e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  42.65 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.49 
 
 		 659 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  31.3 
 
 		 670 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.29 
 
 		 646 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  29.07 
 
 		 568 aa  110  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  30 
 
 		 568 aa  107  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  32.41 
 
 		 553 aa  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.6 
 
 		 572 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  26.56 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  24.93 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.26 
 
 		 1518 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  32.08 
 
 		 1498 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.7 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  28.95 
 
 		 1507 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  23.83 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  25.51 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  23.65 
 
 		 368 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  23.01 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  23 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  28.42 
 
 		 1507 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  22.54 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  37.11 
 
 		 591 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  22.54 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  26.46 
 
 		 1516 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  25.96 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0251  glutamate synthase (NADPH) large subunit  28.71 
 
 		 1511 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  25.5 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  24.51 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  29.2 
 
 		 1510 aa  63.2  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  21.34 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  22.26 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  22.26 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  22.26 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  27.47 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  24.9 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  23.36 
 
 		 1513 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  25.21 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  26.2 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  32.63 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  26.04 
 
 		 1510 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  26.56 
 
 		 1510 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  22.44 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  24.77 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  23.08 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  23.9 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  30.09 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  26.16 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  24.17 
 
 		 375 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  25.75 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.14 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  23.6 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  28.99 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  26.32 
 
 		 1512 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0131  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.77 
 
 		 612 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.533815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0002  glutamate synthase  27.48 
 
 		 1512 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  26.21 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2807  glutamate synthase (ferredoxin)  26.32 
 
 		 1512 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  22.35 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0008  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.14 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.382171 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2781  glutamate synthase (ferredoxin)  26.79 
 
 		 1512 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975525  normal  0.828421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  27.35 
 
 		 1509 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  24.39 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0186  glutamate synthase, large subunit  26.17 
 
 		 1533 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1988  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.85 
 
 		 1497 aa  57  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  22.82 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0118  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.51 
 
 		 609 aa  56.6  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.101384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.95 
 
 		 608 aa  56.6  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  24.44 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1342  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.83 
 
 		 620 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2140  glutamate synthase (ferredoxin)  28.2 
 
 		 1510 aa  56.2  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  26.37 
 
 		 475 aa  56.2  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>