More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0030 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 
670 aa  1341    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  46.88 
 
 
659 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  46.34 
 
 
646 aa  552  1e-156  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  38.03 
 
 
572 aa  296  9e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  33.64 
 
 
568 aa  282  1e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  36.79 
 
 
568 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  31.8 
 
 
553 aa  263  6.999999999999999e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  47.09 
 
 
245 aa  178  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  44.85 
 
 
252 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  33.42 
 
 
364 aa  174  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  44.19 
 
 
250 aa  171  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  35.08 
 
 
355 aa  169  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  36.07 
 
 
245 aa  169  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  36.07 
 
 
245 aa  169  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  41.32 
 
 
246 aa  164  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  44.56 
 
 
245 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  41.58 
 
 
242 aa  161  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  33.1 
 
 
261 aa  157  6e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  32.78 
 
 
365 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  42.4 
 
 
251 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  40.25 
 
 
281 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  36.07 
 
 
248 aa  154  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  34.08 
 
 
368 aa  154  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  41.18 
 
 
249 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  34.04 
 
 
373 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  34.04 
 
 
263 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  39.21 
 
 
264 aa  151  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.65 
 
 
240 aa  151  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.22 
 
 
256 aa  150  8e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  32.86 
 
 
256 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  33.33 
 
 
256 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  34.69 
 
 
349 aa  148  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  33.15 
 
 
371 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  31.25 
 
 
372 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  31.25 
 
 
395 aa  147  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  42.44 
 
 
251 aa  147  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  31.87 
 
 
364 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  33.46 
 
 
247 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  30.62 
 
 
359 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  32.74 
 
 
382 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  40.72 
 
 
248 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  30.83 
 
 
376 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  31.08 
 
 
361 aa  144  8e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  33.24 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  30.71 
 
 
376 aa  143  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  31.96 
 
 
374 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  33.05 
 
 
350 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  31.59 
 
 
350 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  31.3 
 
 
350 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  30.41 
 
 
363 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  30.22 
 
 
376 aa  140  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  39.6 
 
 
245 aa  140  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  36.14 
 
 
256 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  38.31 
 
 
247 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  32.97 
 
 
369 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  30.71 
 
 
364 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  39.07 
 
 
248 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  29.52 
 
 
363 aa  133  9e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  36.87 
 
 
246 aa  132  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  36.6 
 
 
256 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  30.67 
 
 
378 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  36.6 
 
 
256 aa  130  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.85 
 
 
363 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  28.12 
 
 
363 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  28.12 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  31.25 
 
 
350 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.51 
 
 
635 aa  88.6  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.02 
 
 
777 aa  84  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.6 
 
 
777 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
793 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.44 
 
 
777 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.59 
 
 
776 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
794 aa  76.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  28.96 
 
 
228 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  34.43 
 
 
771 aa  64.7  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.96 
 
 
230 aa  64.7  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.3 
 
 
228 aa  64.7  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  30.17 
 
 
376 aa  63.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  30.49 
 
 
376 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  31.32 
 
 
229 aa  62  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  30.22 
 
 
228 aa  62.4  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.12 
 
 
228 aa  61.6  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  27.62 
 
 
225 aa  60.8  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  28.8 
 
 
228 aa  60.8  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.64 
 
 
1521 aa  60.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  29.28 
 
 
228 aa  60.1  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  29.03 
 
 
305 aa  60.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  28.88 
 
 
235 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  30.24 
 
 
376 aa  58.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.28 
 
 
227 aa  57.4  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  28.89 
 
 
228 aa  57.4  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  30.83 
 
 
771 aa  57.4  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.64 
 
 
224 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.67 
 
 
1524 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  26.77 
 
 
232 aa  57  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.87 
 
 
238 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.59 
 
 
1530 aa  57  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.43 
 
 
381 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.35 
 
 
238 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.35 
 
 
238 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>