More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1092 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  85.95 
 
 
363 aa  671    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  85.4 
 
 
363 aa  665    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 
363 aa  746    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  86.23 
 
 
363 aa  670    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  73.96 
 
 
361 aa  585  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  53.3 
 
 
350 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  50.55 
 
 
350 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  51.52 
 
 
349 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  50.14 
 
 
350 aa  383  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  50.28 
 
 
382 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  46.43 
 
 
355 aa  358  7e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.8 
 
 
364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  46.98 
 
 
395 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  46.98 
 
 
372 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  45.11 
 
 
368 aa  353  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  45.97 
 
 
371 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  47.41 
 
 
364 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  45.43 
 
 
373 aa  349  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  47.95 
 
 
365 aa  349  4e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  47.22 
 
 
369 aa  345  5e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  45.05 
 
 
364 aa  338  9e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  45.65 
 
 
376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  45.36 
 
 
376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  47.41 
 
 
359 aa  334  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  45.65 
 
 
376 aa  333  3e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  46.43 
 
 
350 aa  332  4e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  44.23 
 
 
374 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  44.92 
 
 
339 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  42.12 
 
 
378 aa  318  7e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  43.48 
 
 
363 aa  296  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.61 
 
 
659 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.69 
 
 
646 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  29.52 
 
 
670 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  25.14 
 
 
568 aa  99  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.94 
 
 
572 aa  89  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  25.34 
 
 
568 aa  87.8  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  23.89 
 
 
553 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  24.55 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  22.79 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  24.89 
 
 
302 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  23.64 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  23.32 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  23.61 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  23.5 
 
 
376 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  24.03 
 
 
311 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0341  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.24 
 
 
1489 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  24.55 
 
 
316 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.89 
 
 
299 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  24.11 
 
 
311 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  22.58 
 
 
1505 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2866  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.9 
 
 
1527 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  26.3 
 
 
1583 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  21.88 
 
 
299 aa  58.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  22.75 
 
 
305 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  26.3 
 
 
1583 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  22.52 
 
 
1519 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1988  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.67 
 
 
1497 aa  57.4  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_51214  ferredoxin-dependent glutamate synthase, fusion of large and small subunits  24.67 
 
 
1591 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  21.61 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  23.01 
 
 
306 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1350  Glutamate synthase (ferredoxin)  25 
 
 
1527 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000183365 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  25.93 
 
 
1583 aa  56.6  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  22.74 
 
 
299 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  25 
 
 
301 aa  56.6  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  24.64 
 
 
1574 aa  56.2  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  21.7 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2618  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.46 
 
 
608 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.84 
 
 
1510 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  27.05 
 
 
1571 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3654  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.02 
 
 
1558 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  23.18 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  25.83 
 
 
1563 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  21.4 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  24.66 
 
 
308 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.53 
 
 
1468 aa  53.9  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  21.83 
 
 
298 aa  53.9  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3734  glutamate synthase large subunit  25 
 
 
1573 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  23.66 
 
 
297 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  24.55 
 
 
301 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  25 
 
 
376 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  20.38 
 
 
376 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2854  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  35.42 
 
 
608 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  25.88 
 
 
1574 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  24.55 
 
 
301 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  21.92 
 
 
301 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  22.77 
 
 
1483 aa  52.8  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  23.64 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3591  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.4 
 
 
1567 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213312  hitchhiker  0.00000278043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  21.69 
 
 
298 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  22.97 
 
 
302 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3875  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.98 
 
 
1566 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1371  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.58 
 
 
1578 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25743 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.11 
 
 
1469 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2683  glutamate synthase subunit alpha  24.89 
 
 
1481 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.141774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3031  glutamate synthase (ferredoxin)  26.75 
 
 
1553 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  26.11 
 
 
1507 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0741  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.31 
 
 
1577 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.704994  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0842  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.51 
 
 
1560 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.237024  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.29 
 
 
1572 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1604  glutamate synthase (ferredoxin)  28.11 
 
 
1554 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.505347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>