More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1575 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 
316 aa  647    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  92.38 
 
 
311 aa  591  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  93.02 
 
 
311 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  77.74 
 
 
297 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  67.77 
 
 
297 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  67.33 
 
 
299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  65.67 
 
 
299 aa  394  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  66.33 
 
 
298 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  63.12 
 
 
301 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  64.24 
 
 
308 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  63.12 
 
 
301 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  61.13 
 
 
301 aa  381  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  60.93 
 
 
302 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  59.93 
 
 
306 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  60.54 
 
 
301 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  60.26 
 
 
306 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  59.47 
 
 
299 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  59.27 
 
 
301 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  52.98 
 
 
299 aa  335  7.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  49.33 
 
 
296 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48 
 
 
298 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  49.17 
 
 
302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  50.17 
 
 
302 aa  287  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  47.35 
 
 
302 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  46.38 
 
 
302 aa  279  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.02 
 
 
305 aa  278  6e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  47.67 
 
 
298 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  47.68 
 
 
298 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  47.68 
 
 
298 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  47.68 
 
 
298 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  46.53 
 
 
302 aa  255  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  44.52 
 
 
302 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.69 
 
 
611 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.26 
 
 
350 aa  85.9  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  30 
 
 
374 aa  85.9  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.12 
 
 
611 aa  85.9  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0708  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  38 
 
 
612 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.91 
 
 
610 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  27.55 
 
 
474 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  37.17 
 
 
608 aa  82.8  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.76 
 
 
610 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
469 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1801  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  38.36 
 
 
611 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.64 
 
 
610 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1419  amidophosphoribosyltransferase  28.34 
 
 
461 aa  80.5  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0127132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4064  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  38.84 
 
 
614 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  32.4 
 
 
480 aa  79.7  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  26.15 
 
 
487 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3302  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  33.79 
 
 
608 aa  79.3  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  29.95 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.97 
 
 
659 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  31.16 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  32.4 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  25.45 
 
 
488 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  27.33 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  31.18 
 
 
472 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  29.3 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.94 
 
 
610 aa  78.2  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  31.93 
 
 
475 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1342  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  34.59 
 
 
620 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  29.09 
 
 
459 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  29.3 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.03 
 
 
610 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2118  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase  38.52 
 
 
605 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.710102  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.76 
 
 
611 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  31.17 
 
 
468 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2748  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.41 
 
 
604 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0073  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.1 
 
 
609 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.653e-29 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  31.52 
 
 
487 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1205  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  37.19 
 
 
621 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  29.34 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  41.18 
 
 
612 aa  76.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  33.33 
 
 
610 aa  76.6  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2426  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  32.39 
 
 
609 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184466  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.76 
 
 
611 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0090  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.1 
 
 
609 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0489544  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0095  amidophosphoribosyltransferase  28.14 
 
 
476 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2407  amidophosphoribosyltransferase  29.94 
 
 
487 aa  76.3  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.848054  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
479 aa  76.3  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
459 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  32.28 
 
 
611 aa  75.9  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0727  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.11 
 
 
602 aa  75.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2095  amidophosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
480 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.778059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
494 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2893  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.13 
 
 
604 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
494 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  32.03 
 
 
610 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4553  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  38.53 
 
 
608 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  30.93 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
456 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  35.14 
 
 
603 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0810967  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.72 
 
 
611 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3499  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  41.18 
 
 
612 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.48 
 
 
609 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.08 
 
 
612 aa  74.7  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
496 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0619  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.38 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247891  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1164  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  35.14 
 
 
603 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402042  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>