More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3948 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  71.03 
 
 		 609 aa  882    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  71.03 
 
 		 609 aa  882    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.03 
 
 		 609 aa  882    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.85 
 
 		 611 aa  820    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0015  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.7 
 
 		 610 aa  747    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0178  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.75 
 
 		 612 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.149941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4942  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  76.27 
 
 		 610 aa  965    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.08 
 
 		 610 aa  905    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.3 
 
 		 609 aa  947    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5595  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  65.09 
 
 		 611 aa  780    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.3 
 
 		 609 aa  948    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3379  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.75 
 
 		 610 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2893  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.28 
 
 		 604 aa  694    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2748  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.79 
 
 		 604 aa  692    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.36 
 
 		 611 aa  792    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.96 
 
 		 614 aa  677    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.666768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3931  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  56.37 
 
 		 607 aa  677    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.9 
 
 		 605 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0230  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.03 
 
 		 612 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0641  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.43 
 
 		 636 aa  649    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.38 
 
 		 609 aa  696    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.03 
 
 		 609 aa  882    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4036  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.75 
 
 		 629 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529211 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.59 
 
 		 610 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.698391  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0118  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.08 
 
 		 609 aa  665    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.101384  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1120  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.9 
 
 		 605 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3071  glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerising  62.42 
 
 		 611 aa  768    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.93 
 
 		 610 aa  782    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2977  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.12 
 
 		 605 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.03 
 
 		 609 aa  882    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1985  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  58.01 
 
 		 611 aa  727    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4463  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  54.41 
 
 		 605 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14983  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6331  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.28 
 
 		 605 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.52 
 
 		 609 aa  900    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0095  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  55.98 
 
 		 620 aa  665    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607775 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2280  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.81 
 
 		 615 aa  682    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0733562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5899  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  53.27 
 
 		 639 aa  653    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.1 
 
 		 608 aa  726    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2426  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.43 
 
 		 609 aa  711    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184466  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1692  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  58.09 
 
 		 617 aa  724    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0313  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.28 
 
 		 615 aa  697    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.36 
 
 		 609 aa  897    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0336  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.27 
 
 		 610 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0348  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.08 
 
 		 605 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0288  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.43 
 
 		 610 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.14 
 
 		 609 aa  938    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  61.05 
 
 		 610 aa  795    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2042  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.75 
 
 		 610 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.52 
 
 		 609 aa  899    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.87 
 
 		 609 aa  887    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.33 
 
 		 627 aa  653    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0149883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  100 
 
 		 611 aa  1245    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.92 
 
 		 610 aa  894    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.08 
 
 		 611 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0675  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.29 
 
 		 616 aa  669    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0208  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.35 
 
 		 605 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.98 
 
 		 609 aa  942    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.3 
 
 		 609 aa  948    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0013  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing]  57.84 
 
 		 611 aa  724    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.9 
 
 		 610 aa  716    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  64.72 
 
 		 616 aa  813    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2397  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.12 
 
 		 614 aa  679    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0187  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.71 
 
 		 612 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.225052 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.65 
 
 		 612 aa  685    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.52 
 
 		 611 aa  816    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3050  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.75 
 
 		 610 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  75.12 
 
 		 609 aa  954    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.81 
 
 		 609 aa  937    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0846  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.25 
 
 		 605 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2368  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.46 
 
 		 605 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  66.01 
 
 		 611 aa  813    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  74.3 
 
 		 610 aa  934    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2740  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.72 
 
 		 607 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2503  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.95 
 
 		 605 aa  651    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.75 
 
 		 610 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.52 
 
 		 610 aa  804    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.98 
 
 		 609 aa  942    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.81 
 
 		 609 aa  939    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2865  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  61.6 
 
 		 610 aa  765    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4040  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.3 
 
 		 609 aa  942    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.03 
 
 		 609 aa  881    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.12 
 
 		 605 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  65.85 
 
 		 611 aa  821    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.8 
 
 		 609 aa  950    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  53.59 
 
 		 605 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.536522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.46 
 
 		 611 aa  783    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1327  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.25 
 
 		 605 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2982  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.46 
 
 		 605 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3002  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.79 
 
 		 605 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1309  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.25 
 
 		 605 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.78 
 
 		 611 aa  785    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.52 
 
 		 609 aa  900    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.98 
 
 		 609 aa  944    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2242  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.75 
 
 		 610 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0560  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  54.63 
 
 		 619 aa  655    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.927649 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3951  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.14 
 
 		 609 aa  944    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101747  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  74.14 
 
 		 609 aa  947    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.79 
 
 		 618 aa  662    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.442506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.81 
 
 		 609 aa  940    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.26 
 
 		 611 aa  895    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>