More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0085 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  71.36 
 
 
609 aa  912    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  71.36 
 
 
609 aa  912    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  79.21 
 
 
610 aa  1015    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  62.52 
 
 
611 aa  806    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0015  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  61.05 
 
 
610 aa  742    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0178  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.87 
 
 
612 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.149941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4942  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  68.74 
 
 
610 aa  893    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.45 
 
 
608 aa  738    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  68.9 
 
 
609 aa  884    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5595  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  60.88 
 
 
611 aa  758    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3379  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.98 
 
 
610 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2893  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  57.28 
 
 
604 aa  707    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2748  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.96 
 
 
604 aa  706    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5117  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  61.05 
 
 
611 aa  767    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.92 
 
 
614 aa  681    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.666768  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3931  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  54.83 
 
 
607 aa  677    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2426  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  57.28 
 
 
609 aa  705    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184466  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0230  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.19 
 
 
612 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4036  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.61 
 
 
629 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.529211 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2793  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  57.19 
 
 
609 aa  693    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4136  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.7 
 
 
609 aa  909    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0361576  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0517  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.82 
 
 
610 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.698391  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5427  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  62.68 
 
 
611 aa  808    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15944  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1120  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.54 
 
 
605 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3071  glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerising  61.11 
 
 
611 aa  739    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  61.7 
 
 
610 aa  773    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.52 
 
 
609 aa  913    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5899  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.57 
 
 
639 aa  651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73 
 
 
609 aa  920    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4463  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  53.19 
 
 
605 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14983  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6331  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.85 
 
 
605 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.56 
 
 
609 aa  892    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0118  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.34 
 
 
609 aa  671    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.101384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  62.52 
 
 
611 aa  802    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  100 
 
 
611 aa  1248    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2280  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  56.06 
 
 
615 aa  705    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0733562 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.36 
 
 
609 aa  912    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.16 
 
 
609 aa  921    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1692  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.8 
 
 
617 aa  732    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0313  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  55.75 
 
 
615 aa  691    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0013  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing]  56.21 
 
 
611 aa  722    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0336  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.66 
 
 
610 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0348  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  51.88 
 
 
605 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.578101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0288  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.5 
 
 
610 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2977  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.85 
 
 
605 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392279  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3627  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.04 
 
 
605 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.98 
 
 
610 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.23 
 
 
609 aa  886    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.16 
 
 
609 aa  920    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.61 
 
 
627 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0149883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  70.26 
 
 
611 aa  895    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2242  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.98 
 
 
610 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.37 
 
 
611 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0675  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.77 
 
 
616 aa  654    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0208  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.81 
 
 
605 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.07 
 
 
609 aa  887    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.36 
 
 
609 aa  912    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1309  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.7 
 
 
605 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3280  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.64 
 
 
610 aa  729    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333472  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1985  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  56.21 
 
 
611 aa  721    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2397  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  55.92 
 
 
614 aa  684    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0187  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.71 
 
 
612 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.225052 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  56.4 
 
 
612 aa  710    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60.88 
 
 
611 aa  770    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3050  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.98 
 
 
610 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.07 
 
 
609 aa  881    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.07 
 
 
609 aa  889    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0846  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.7 
 
 
605 aa  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2368  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.36 
 
 
605 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  71.36 
 
 
609 aa  912    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  64.48 
 
 
610 aa  837    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.05 
 
 
609 aa  895    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  80.03 
 
 
610 aa  1027    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2042  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.98 
 
 
610 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.85 
 
 
605 aa  657    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  72.18 
 
 
610 aa  918    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3872  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  63.67 
 
 
610 aa  817    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.39 
 
 
609 aa  887    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.56 
 
 
609 aa  889    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2865  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  59.25 
 
 
610 aa  733    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4040  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.38 
 
 
609 aa  900    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.54 
 
 
605 aa  648    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3029  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  54.34 
 
 
605 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40621  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2503  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.68 
 
 
605 aa  651    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208753  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3002  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.68 
 
 
605 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978616  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.37 
 
 
605 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60.88 
 
 
611 aa  768    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1327  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  52.7 
 
 
605 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2982  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  53.36 
 
 
605 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0095  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  54.95 
 
 
620 aa  660    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5196  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  62.36 
 
 
611 aa  798    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.56 
 
 
609 aa  893    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0560  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  53.28 
 
 
619 aa  652    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.927649 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.05 
 
 
609 aa  895    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.56 
 
 
609 aa  888    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3951  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  69.89 
 
 
609 aa  893    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101747  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  73.16 
 
 
609 aa  921    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  70.05 
 
 
609 aa  896    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4602  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  60.06 
 
 
616 aa  781    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  52.8 
 
 
618 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.442506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>