More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0536 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 		 372 aa  771    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  99.73 
 
 		 395 aa  771    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  58.76 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  56.71 
 
 		 371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  59.66 
 
 		 364 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  57.63 
 
 		 364 aa  450  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  55.19 
 
 		 368 aa  445  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  56.41 
 
 		 355 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  59.52 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  56.49 
 
 		 376 aa  429  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  56.55 
 
 		 365 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  56.22 
 
 		 376 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  56.3 
 
 		 364 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  55.9 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  56.81 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  54.89 
 
 		 376 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  53.54 
 
 		 374 aa  413  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  55.01 
 
 		 350 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  51.96 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  50.14 
 
 		 378 aa  391  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  53.76 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  50.87 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  48.7 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  50.14 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  48.76 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.76 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  48.21 
 
 		 363 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  48.32 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  46.98 
 
 		 363 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  46.96 
 
 		 350 aa  332  9e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.56 
 
 		 659 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  31.25 
 
 		 670 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.23 
 
 		 646 aa  147  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  27.83 
 
 		 568 aa  117  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  25.51 
 
 		 568 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  26.3 
 
 		 553 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.07 
 
 		 572 aa  89.7  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  27.73 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  30.37 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  29.3 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  27.48 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  28.37 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.27 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  26.24 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  29.72 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.13 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  29.41 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  30.37 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  27.1 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  25.48 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  28.16 
 
 		 1482 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  25.54 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  28.04 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  28.04 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  28.99 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  28.04 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  24.8 
 
 		 1509 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  26.64 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  27.32 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  25.34 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.57 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.59 
 
 		 298 aa  67  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  27.32 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  27.49 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  26.07 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  26.07 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  28.92 
 
 		 1498 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.33 
 
 		 1518 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  24.17 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  28.02 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  26.54 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  24.88 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  22.78 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0341  glutamate synthase (NADH) large subunit  27.8 
 
 		 1489 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  29.41 
 
 		 1482 aa  63.2  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3031  glutamate synthase (ferredoxin)  25.58 
 
 		 1553 aa  63.2  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  29.61 
 
 		 1482 aa  62.8  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5773  glutamate synthase subunit alpha  25.96 
 
 		 1481 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66570  glutamate synthase subunit alpha  25.96 
 
 		 1481 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  26.48 
 
 		 1583 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  27.6 
 
 		 1481 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  26.36 
 
 		 1583 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45210  glutamate synthase subunit alpha  24.81 
 
 		 1480 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  26.27 
 
 		 1486 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  35.24 
 
 		 610 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  27.27 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0477  glutamate synthase (ferredoxin)  27.86 
 
 		 1567 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0794035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  27.7 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  27.64 
 
 		 1486 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  27.64 
 
 		 1486 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  26.12 
 
 		 1486 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2805  glutamate synthase (ferredoxin)  29.72 
 
 		 1525 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  29.41 
 
 		 1482 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5126  glutamate synthase subunit alpha  26.29 
 
 		 1481 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.979784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.06 
 
 		 1468 aa  61.2  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.57 
 
 		 1575 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.49 
 
 		 1505 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  27.27 
 
 		 1486 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  29.61 
 
 		 1482 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  25.88 
 
 		 1485 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>