More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2361 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 
364 aa  751    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  69.44 
 
 
365 aa  539  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  68.38 
 
 
355 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  65.28 
 
 
368 aa  510  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  58.94 
 
 
374 aa  472  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  61.45 
 
 
373 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  62.18 
 
 
371 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  59.83 
 
 
369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  57.63 
 
 
395 aa  450  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  57.63 
 
 
372 aa  450  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  63.02 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  56.55 
 
 
359 aa  441  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  58.4 
 
 
363 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  57.88 
 
 
364 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  58.45 
 
 
364 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  54.34 
 
 
376 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  55.4 
 
 
376 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  53.56 
 
 
376 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  53.06 
 
 
350 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  52.54 
 
 
378 aa  394  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  48.1 
 
 
350 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  50.14 
 
 
363 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  49.86 
 
 
363 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  49.59 
 
 
361 aa  367  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  50.87 
 
 
349 aa  361  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  49.05 
 
 
363 aa  359  3e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  47.23 
 
 
350 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  47.41 
 
 
363 aa  350  3e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  48.98 
 
 
382 aa  346  4e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  44.02 
 
 
350 aa  311  9e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  33.42 
 
 
670 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.56 
 
 
659 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.97 
 
 
646 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  28.33 
 
 
568 aa  115  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  27.97 
 
 
568 aa  103  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  31.34 
 
 
553 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.57 
 
 
572 aa  92  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  27.12 
 
 
368 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  27.18 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.53 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  24.87 
 
 
1507 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  28.24 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.54 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  24.88 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  26.46 
 
 
311 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  27.31 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  26.85 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.36 
 
 
297 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  23.29 
 
 
302 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  26.34 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  24.79 
 
 
298 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  26.64 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  26.64 
 
 
302 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  26.39 
 
 
306 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  24.51 
 
 
299 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  28.27 
 
 
297 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0672  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.69 
 
 
1534 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  24.52 
 
 
302 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  25 
 
 
298 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  27.03 
 
 
301 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.79 
 
 
1510 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0628  glutamate synthase (NADH) large subunit  24.04 
 
 
1533 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  23.98 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  25 
 
 
302 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0186  glutamate synthase, large subunit  28.17 
 
 
1533 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  26.85 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  25.7 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3016  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.84 
 
 
1524 aa  59.7  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  26.15 
 
 
376 aa  59.7  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.74 
 
 
1483 aa  59.7  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  25.7 
 
 
301 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0502  glutamate synthase (ferredoxin)  28.44 
 
 
1533 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.154267  normal  0.477392 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0781  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.21 
 
 
1533 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.61 
 
 
1519 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.61 
 
 
610 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  24.52 
 
 
298 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  24.52 
 
 
298 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  24.52 
 
 
298 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  23.68 
 
 
302 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  25.22 
 
 
1510 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.64 
 
 
611 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  25.15 
 
 
1482 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.64 
 
 
611 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0612  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.34 
 
 
1539 aa  56.6  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  24.4 
 
 
376 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  22.57 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5409  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.96 
 
 
611 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323982  hitchhiker  0.00848262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5291  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.96 
 
 
611 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268199  normal  0.456401 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.4 
 
 
298 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  22.99 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  21.83 
 
 
376 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2866  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.24 
 
 
1527 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.36 
 
 
610 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0488  glutamate synthase (ferredoxin)  23.68 
 
 
1516 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1937  Glutamate synthase (ferredoxin)  23.66 
 
 
1533 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1346  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.16 
 
 
1520 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  23.62 
 
 
1509 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.47 
 
 
1511 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.01 
 
 
610 aa  54.3  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2763  glutamate synthase subunit alpha  24.68 
 
 
1491 aa  53.5  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>