More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0780 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 350 aa  726    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  69.71 
 
 		 350 aa  536  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  69.71 
 
 		 349 aa  527  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  66.48 
 
 		 350 aa  521  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  68.57 
 
 		 382 aa  519  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  59.89 
 
 		 350 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  51.79 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  50.96 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  50.96 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  49.42 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  50.85 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  50.14 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  50.57 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  49.86 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  49.31 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  48.85 
 
 		 374 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  50.14 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  50.14 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.69 
 
 		 368 aa  371  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  50.29 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  48.84 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  51.8 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  46.96 
 
 		 376 aa  362  4e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  47.54 
 
 		 376 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  48.41 
 
 		 365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  47.25 
 
 		 376 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  47.23 
 
 		 364 aa  355  5e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  48.27 
 
 		 359 aa  352  4e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  44.13 
 
 		 378 aa  318  6e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  45.8 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.98 
 
 		 659 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.44 
 
 		 646 aa  148  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  33.05 
 
 		 670 aa  141  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  33.01 
 
 		 568 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  31 
 
 		 553 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  26.57 
 
 		 568 aa  99.8  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.02 
 
 		 572 aa  97.1  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  24.37 
 
 		 1519 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  23.42 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  28.18 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.54 
 
 		 1518 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  25.36 
 
 		 1513 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  29.47 
 
 		 1507 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  31.58 
 
 		 1507 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  30.94 
 
 		 1498 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  25.69 
 
 		 1505 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  23.77 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  28.24 
 
 		 1510 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  24.88 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  26.34 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  23.17 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  28.95 
 
 		 1510 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  27.5 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  22.94 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280725 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  27.57 
 
 		 591 aa  65.9  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.16 
 
 		 1483 aa  66.2  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  26.98 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.78 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.13 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  27.13 
 
 		 608 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  28 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  26.77 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  23.48 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  23.71 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.8 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  22.22 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  25.4 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  22.49 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2694  Glutamate synthase (NADH)  27.66 
 
 		 1569 aa  62.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  22.29 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  22.96 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  24.01 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  21.99 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  24.1 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  22.69 
 
 		 1510 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  22.42 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1110  amidophosphoribosyltransferase  24.54 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  26.18 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6350  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.32 
 
 		 611 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  21.82 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  22.16 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  26.98 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  24.1 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  24.14 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  25.12 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  23.22 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  24.1 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1676  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.41 
 
 		 604 aa  59.7  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0598  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.69 
 
 		 611 aa  59.7  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  25.13 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  23.78 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  24.17 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  25.39 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  23.86 
 
 		 465 aa  59.3  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.71 
 
 		 611 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  27.84 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  23.78 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  27.05 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1477  amidophosphoribosyltransferase  26.7 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2823  glutamate synthase (NADPH) large subunit  27.36 
 
 		 1510 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>