42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1375 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  781    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  70.16 
 
 		 376 aa  566  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  64.34 
 
 		 376 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  64.63 
 
 		 376 aa  522  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  63.03 
 
 		 376 aa  512  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2387  glutamate synthase (NADPH)  63.73 
 
 		 375 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  63.54 
 
 		 375 aa  508  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  38.57 
 
 		 368 aa  256  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  36.84 
 
 		 368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  39.38 
 
 		 368 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  29.52 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  30.52 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  23.39 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  27.86 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  30.17 
 
 		 670 aa  63.2  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  29.05 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  26.94 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  29.84 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.13 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.48 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.24 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  27.05 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  28.65 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  28.99 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  23.58 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  25.35 
 
 		 361 aa  57  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.84 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.41 
 
 		 659 aa  55.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  25.12 
 
 		 364 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  25.33 
 
 		 349 aa  52.8  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  25 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  25 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  23.74 
 
 		 363 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  23.29 
 
 		 363 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.42 
 
 		 646 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  24.19 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.62 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.04 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  25.42 
 
 		 488 aa  47  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  27.35 
 
 		 1478 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  22.37 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1910  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  35.96 
 
 		 608 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701162  normal  0.896342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>