More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0334 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 350 aa  726    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  71.84 
 
 		 382 aa  536  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  61.49 
 
 		 350 aa  476  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  59.89 
 
 		 350 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  60.52 
 
 		 350 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  62.36 
 
 		 349 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  45.88 
 
 		 361 aa  347  1e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  46.15 
 
 		 363 aa  339  5e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  46.15 
 
 		 363 aa  338  9e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  46.43 
 
 		 363 aa  332  4e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  46.96 
 
 		 395 aa  332  6e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  45.33 
 
 		 363 aa  332  8e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  46.96 
 
 		 372 aa  332  8e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  44.35 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  44.38 
 
 		 368 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  44.35 
 
 		 373 aa  322  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  43.8 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  44.48 
 
 		 369 aa  322  8e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  43.55 
 
 		 376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  44.38 
 
 		 376 aa  320  3e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  44.67 
 
 		 359 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  43.5 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  42.9 
 
 		 365 aa  314  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  42.69 
 
 		 376 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  44.02 
 
 		 364 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  45.54 
 
 		 339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  43.02 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  41.21 
 
 		 374 aa  298  8e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  39.54 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  41.21 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.97 
 
 		 659 aa  149  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.94 
 
 		 646 aa  139  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  31.25 
 
 		 670 aa  122  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  33.01 
 
 		 568 aa  99.8  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  26.65 
 
 		 553 aa  99.4  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  34.39 
 
 		 568 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.73 
 
 		 572 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  24.16 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  28.1 
 
 		 1510 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  26.64 
 
 		 1513 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  25.93 
 
 		 1510 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  28.44 
 
 		 1498 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  25.53 
 
 		 1507 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  24.51 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.24 
 
 		 1518 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  27.6 
 
 		 1507 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  29.44 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  25.51 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.2 
 
 		 1519 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  25.82 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  25.35 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  25.34 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  24.28 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  27.65 
 
 		 485 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  27.65 
 
 		 485 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  27.65 
 
 		 485 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  26.42 
 
 		 456 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  25.35 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  23.08 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  23.24 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  27.44 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  25.47 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  26.49 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  23.23 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  23.47 
 
 		 479 aa  59.7  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  28.65 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  24.08 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  20.82 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1130  amidophosphoribosyltransferase  30.37 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1152  amidophosphoribosyltransferase  30.37 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0598  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  26.67 
 
 		 611 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  27.55 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.47 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.57 
 
 		 1505 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1110  amidophosphoribosyltransferase  24.77 
 
 		 447 aa  57  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  23.14 
 
 		 311 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0655  amidophosphoribosyltransferase  30.39 
 
 		 494 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  24.77 
 
 		 500 aa  56.2  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  23.47 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  23.45 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  21.7 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  24.88 
 
 		 465 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  24.69 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  20.85 
 
 		 472 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  23.56 
 
 		 469 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  25 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  24.66 
 
 		 492 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  23.7 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  26 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3049  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  26.74 
 
 		 604 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.749851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.77 
 
 		 609 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  25.36 
 
 		 470 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0095  amidophosphoribosyltransferase  24.87 
 
 		 476 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.77 
 
 		 609 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  23.5 
 
 		 1482 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.77 
 
 		 609 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3656  glutamate synthase subunit alpha  25.57 
 
 		 1516 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.166032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>