More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0672 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  99.79 
 
 
473 aa  964    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
473 aa  965    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  54.31 
 
 
475 aa  522  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  54.88 
 
 
488 aa  525  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  54.47 
 
 
472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
487 aa  498  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  52.74 
 
 
475 aa  495  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  52.26 
 
 
465 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
474 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  54.15 
 
 
465 aa  491  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  53.38 
 
 
474 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  52.76 
 
 
469 aa  491  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  51.97 
 
 
470 aa  487  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  50.64 
 
 
478 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  52.77 
 
 
459 aa  474  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 
475 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 
481 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  47.54 
 
 
468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 
478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  47.94 
 
 
467 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
471 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
475 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  47.29 
 
 
466 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
493 aa  468  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
477 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  50.84 
 
 
478 aa  463  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  47.58 
 
 
477 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
471 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
488 aa  462  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  48.05 
 
 
474 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
471 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
470 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
494 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
471 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
468 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
494 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  49.02 
 
 
496 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
474 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  47.15 
 
 
470 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  48.71 
 
 
493 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  47.15 
 
 
480 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  48.46 
 
 
472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  47.63 
 
 
503 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  45.24 
 
 
461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
466 aa  450  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  47.6 
 
 
478 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  47.08 
 
 
502 aa  450  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
503 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  47.2 
 
 
495 aa  450  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  46.48 
 
 
482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4541  amidophosphoribosyltransferase  46.85 
 
 
511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4924  amidophosphoribosyltransferase  46.85 
 
 
511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  47.45 
 
 
506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  45.86 
 
 
476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
514 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4628  amidophosphoribosyltransferase  46.85 
 
 
511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  47.48 
 
 
534 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
492 aa  443  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  46.97 
 
 
500 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
512 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
484 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  51.98 
 
 
473 aa  443  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  46.22 
 
 
517 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  44.37 
 
 
505 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  47.01 
 
 
487 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  48.05 
 
 
500 aa  444  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  48.02 
 
 
466 aa  443  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  46.31 
 
 
462 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  47.05 
 
 
527 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
456 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  47.15 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3576  amidophosphoribosyltransferase  47.47 
 
 
517 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0300  amidophosphoribosyltransferase  46.17 
 
 
498 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  46.65 
 
 
488 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  47.46 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  47.25 
 
 
485 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  48.62 
 
 
484 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1052  amidophosphoribosyltransferase  47.01 
 
 
491 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  44.66 
 
 
515 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
459 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  47.25 
 
 
485 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
510 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  47.28 
 
 
511 aa  438  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  47.99 
 
 
459 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  46.87 
 
 
499 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  46.44 
 
 
462 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  47.99 
 
 
459 aa  438  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  46.93 
 
 
488 aa  436  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0948  amidophosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
525 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  45.84 
 
 
506 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>