More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1636 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 467 aa  963    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  72.08 
 
 		 468 aa  710    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  90.77 
 
 		 466 aa  892    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  80.98 
 
 		 477 aa  810    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  82.4 
 
 		 474 aa  815    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  78.16 
 
 		 474 aa  763    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  80.09 
 
 		 475 aa  786    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  80.77 
 
 		 477 aa  810    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  61.86 
 
 		 485 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  61.86 
 
 		 485 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  62.16 
 
 		 485 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  60.93 
 
 		 476 aa  591  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  62.05 
 
 		 484 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  58.31 
 
 		 482 aa  566  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  59 
 
 		 475 aa  555  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  59 
 
 		 481 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  59.48 
 
 		 511 aa  545  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  56.86 
 
 		 502 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  56 
 
 		 461 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  56.57 
 
 		 514 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  56.35 
 
 		 490 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  55.78 
 
 		 487 aa  528  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  55.82 
 
 		 499 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  55.9 
 
 		 503 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  54.61 
 
 		 488 aa  527  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  55.68 
 
 		 486 aa  527  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  54.73 
 
 		 509 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  54.66 
 
 		 500 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  54.87 
 
 		 471 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  54.61 
 
 		 451 aa  523  1e-147  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  54.42 
 
 		 514 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  54.44 
 
 		 488 aa  524  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  55.56 
 
 		 503 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  53.91 
 
 		 517 aa  524  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  55.16 
 
 		 491 aa  522  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  55.11 
 
 		 463 aa  523  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  54.42 
 
 		 471 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  54.95 
 
 		 491 aa  518  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  54.42 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  54.42 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  54.42 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  54.42 
 
 		 471 aa  519  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  54.42 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  54.42 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  54.87 
 
 		 471 aa  518  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  54.95 
 
 		 491 aa  518  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  54.65 
 
 		 471 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  54.42 
 
 		 471 aa  519  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  54.73 
 
 		 491 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  57.21 
 
 		 466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  55.01 
 
 		 470 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  55.92 
 
 		 496 aa  513  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  55.58 
 
 		 491 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  55.68 
 
 		 469 aa  512  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  54.72 
 
 		 501 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  52.81 
 
 		 500 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  54.26 
 
 		 462 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  54.28 
 
 		 462 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  53.86 
 
 		 474 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  54.3 
 
 		 474 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  52.49 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  52.58 
 
 		 493 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  52.21 
 
 		 495 aa  503  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  55.26 
 
 		 472 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  53.13 
 
 		 470 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0122  amidophosphoribosyltransferase  55.41 
 
 		 467 aa  502  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  54.07 
 
 		 496 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  53.9 
 
 		 510 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  54.53 
 
 		 480 aa  501  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  54.79 
 
 		 465 aa  501  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  51.75 
 
 		 497 aa  500  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  54.07 
 
 		 529 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  54.1 
 
 		 475 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  53.01 
 
 		 467 aa  497  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  54.51 
 
 		 514 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  54.2 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  53.63 
 
 		 496 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  51.99 
 
 		 480 aa  495  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 		 487 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  52.03 
 
 		 508 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  53.63 
 
 		 496 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  53.73 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  54.02 
 
 		 502 aa  491  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  52.15 
 
 		 493 aa  490  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  51.35 
 
 		 506 aa  488  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  53.19 
 
 		 496 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 		 486 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  53.51 
 
 		 504 aa  488  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  52.28 
 
 		 499 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  52.47 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  51.79 
 
 		 484 aa  481  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 		 487 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 		 487 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  51.33 
 
 		 503 aa  482  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  52.71 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  49.33 
 
 		 484 aa  478  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  52 
 
 		 475 aa  480  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  50.32 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 		 479 aa  478  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  53.63 
 
 		 496 aa  480  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>