More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0405 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  63.49 
 
 
486 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  66.8 
 
 
488 aa  658    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  80.29 
 
 
517 aa  788    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
493 aa  1004    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  65.01 
 
 
503 aa  632  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  60.98 
 
 
490 aa  627  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  61.99 
 
 
514 aa  622  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  61.75 
 
 
502 aa  624  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  63.9 
 
 
514 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  63.19 
 
 
509 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  62.99 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  63.49 
 
 
503 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  61.95 
 
 
500 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  63.83 
 
 
501 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  63.28 
 
 
510 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  64.56 
 
 
514 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  61.46 
 
 
491 aa  595  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  61.46 
 
 
491 aa  595  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  60.82 
 
 
496 aa  596  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  61.46 
 
 
491 aa  595  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  61.62 
 
 
491 aa  593  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  60.21 
 
 
487 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  60.76 
 
 
499 aa  591  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  60 
 
 
487 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  59.87 
 
 
486 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  60.37 
 
 
500 aa  584  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  61.51 
 
 
491 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  59.34 
 
 
508 aa  578  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  58.9 
 
 
497 aa  578  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
496 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  61.32 
 
 
504 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  57.92 
 
 
496 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  57.72 
 
 
496 aa  566  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  58.47 
 
 
529 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  57.31 
 
 
496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  59.17 
 
 
476 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  60.29 
 
 
504 aa  560  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0446  amidophosphoribosyltransferase  58.44 
 
 
485 aa  549  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0453  amidophosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
509 aa  550  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  55.26 
 
 
496 aa  545  1e-154  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
475 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
481 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  54.96 
 
 
493 aa  532  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  54.8 
 
 
474 aa  525  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  53.35 
 
 
462 aa  524  1e-147  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  52.78 
 
 
477 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
477 aa  521  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  54.92 
 
 
475 aa  519  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  51.31 
 
 
474 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  52.58 
 
 
467 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1109  amidophosphoribosyltransferase  52.04 
 
 
461 aa  506  9.999999999999999e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  52.41 
 
 
466 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  50.73 
 
 
468 aa  502  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0090  amidophosphoribosyltransferase  51.08 
 
 
462 aa  491  1e-137  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  52.49 
 
 
485 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  50.64 
 
 
482 aa  488  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  52.49 
 
 
485 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  50.63 
 
 
495 aa  481  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  52.28 
 
 
485 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  50.76 
 
 
472 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  52.87 
 
 
484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  49.02 
 
 
451 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  52.77 
 
 
511 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  49.68 
 
 
503 aa  465  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
470 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  48.25 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
480 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  48.61 
 
 
471 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  50.21 
 
 
474 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
488 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  48.72 
 
 
493 aa  457  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
466 aa  455  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
469 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  48.18 
 
 
471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  48.18 
 
 
471 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  49.24 
 
 
467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
468 aa  448  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
480 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  47.72 
 
 
465 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 
470 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  47.75 
 
 
471 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  49.25 
 
 
503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  48.46 
 
 
445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  48.01 
 
 
496 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
465 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  49.57 
 
 
482 aa  445  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
487 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
472 aa  439  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  49.24 
 
 
466 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  45.02 
 
 
506 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
487 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>