More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1187 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0446  amidophosphoribosyltransferase  81.2 
 
 
485 aa  801    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  87.53 
 
 
529 aa  904    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
496 aa  1021    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  65.45 
 
 
501 aa  645    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  65.28 
 
 
509 aa  639    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  65.07 
 
 
514 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  81.61 
 
 
496 aa  830    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  61.68 
 
 
503 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  83.87 
 
 
496 aa  865    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0453  amidophosphoribosyltransferase  80.99 
 
 
509 aa  800    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  96.57 
 
 
496 aa  994    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  68.31 
 
 
500 aa  667    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  68.52 
 
 
499 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  65.9 
 
 
514 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  65.53 
 
 
491 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  75.73 
 
 
496 aa  786    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  65.17 
 
 
491 aa  632  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  64.47 
 
 
491 aa  632  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  61.94 
 
 
500 aa  633  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  64.88 
 
 
491 aa  633  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  64.88 
 
 
491 aa  633  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  64.95 
 
 
503 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  64.86 
 
 
514 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  63.51 
 
 
510 aa  611  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  61.68 
 
 
490 aa  613  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  62.55 
 
 
504 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  62.66 
 
 
504 aa  601  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  58.78 
 
 
488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  58.02 
 
 
496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  57.94 
 
 
502 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  59.01 
 
 
486 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  57.31 
 
 
493 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  58.14 
 
 
517 aa  553  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  56 
 
 
499 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  56.45 
 
 
493 aa  540  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  56.12 
 
 
487 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  55.7 
 
 
486 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  56.12 
 
 
487 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  54.32 
 
 
497 aa  519  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
508 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  53.63 
 
 
467 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  54.11 
 
 
476 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  52.97 
 
 
466 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  51.45 
 
 
482 aa  490  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  50.64 
 
 
477 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 
477 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
474 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
474 aa  475  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  51.72 
 
 
475 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  50.99 
 
 
475 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  51.72 
 
 
481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  48.41 
 
 
495 aa  450  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  46.09 
 
 
506 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  47.23 
 
 
484 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
479 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1109  amidophosphoribosyltransferase  47.73 
 
 
461 aa  436  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  48.4 
 
 
471 aa  435  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
471 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  46.85 
 
 
462 aa  437  1e-121  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  47.31 
 
 
503 aa  436  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
471 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
471 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
471 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
471 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
471 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
471 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
471 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
451 aa  433  1e-120  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
471 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  45.3 
 
 
461 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  50.74 
 
 
484 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  49.37 
 
 
485 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  48.62 
 
 
470 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
470 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  47.76 
 
 
471 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  49.26 
 
 
485 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  49.26 
 
 
485 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  45.82 
 
 
472 aa  425  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0141  amidophosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
484 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
511 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
462 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
445 aa  424  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  47.15 
 
 
462 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  47.11 
 
 
480 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1152  amidophosphoribosyltransferase  44.61 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0090  amidophosphoribosyltransferase  45.53 
 
 
462 aa  416  9.999999999999999e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  46.25 
 
 
474 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  47.15 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1130  amidophosphoribosyltransferase  44.61 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
446 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  47.91 
 
 
469 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
463 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  46.87 
 
 
480 aa  413  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  45.94 
 
 
475 aa  415  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  45.11 
 
 
488 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0760  amidophosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
454 aa  414  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0724  amidophosphoribosyltransferase  46.12 
 
 
536 aa  411  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  46.17 
 
 
472 aa  406  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>